| sob老师，今天重庆大学附近新增一例阳性患者，目前学校已经开始限制出行，三天三检了，之前我已经报名参加培训了，但是钱还没交，按照防疫要求我可能来不了了，您之前说过要是学gmx的话量子化学班不是必须参加的，抱歉给您添麻烦了，邮箱也会尽快回的，实在抱歉 |
想喝可乐 发表于 2022-10-27 18:27 不是必须参加，但分子动力学模拟和量子化学有有一些交叉点，比如自己用量子化学程序做势能面扫描然后拟合力场参数、基于量子化学程序计算原子电荷等等，有量子化学知识绝对有好处，也能开阔眼界。而且很多问题如果把分子动力学和量子化学结合起来，分析的时候视角更为全面，能讨论更为深入，也更容易出好文章。比如分子间相互作用，可以通过分子动力学从动态角度考察表观现象，同时可以再结合量子化学和波函数分析手段对相互作用的本质做更细致深入的探讨。 |
| sob老师，请问一下我想学习gromacs需要去参加11月12号的初级量子化学培训班吗，如果需要的话我可以来北京，我做的是液态二氧化碳增稠方向的，想通过分子角度模拟出具体的过程，谢谢老师 |
mol 发表于 2022-9-25 09:52 2018.8。后来的版本不断砍功能，对编译器版本要求不断提升，除了追求GPU加速性外没有太大更到更新版本的意义。 最新版本相对于2018.8所做的所有相对重要的改进，比如后来引入的multiple-time step、C-rescale压浴等，课上都会说。所以不需要担心漏掉什么重要信息 |
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期待高级班赶快上 另外卢老师现在培训班用的gmx是哪个版本呀 |
| 佩服卢老师的精力 |
在经历了本次培训后，可以用醍醐灌顶来形容！Sob老师专业且系统地讲解了分子动力学模拟计算的理论知识，并以GROMACS（包含但不限于）程序为主体，讲述了分子动力学模拟思路、模拟方法，并结合VMD等对计算化学科研制图及数据后续的处理分析进行了详细教学，对于我一个计算化学新手来说十分友好，收获巨大！本次培训内容极为丰富，在课后仍需很长一段时间进行复习、消化、实操。对之前自己稀里糊涂的模拟经历有了深刻反思并加深了理解，同时使之后的模拟过程有了清晰的思路，再次真心感谢Sob老师！！！！！ |
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| + 8 | 谢谢 |
| 平时做研究就经常查阅卢老师的博文，去年报的第10届由于疫情转到这次第11届，听完之后收获很大，内容非常丰富，软件的具体操作细节也都列出来，对于我这种新手来说非常友好，但估计要花很多时间来消化这些知识。另外非常佩服卢老师的精力，我靠着上午和下午各一杯咖啡才勉强顶住，希望未来有机会把卢老师的课都刷一遍。 |
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| + 5 | 谢谢 |
这次的gmx培训班内容太充实太满了（估计得花一年半载来消化x），4天的线下课程真的是全靠功能饮料续命，再次真心佩服sob老师的喉咙和肝 这两天再次复习讲义和观看补充视频，感觉对很多东西都有了更深一层的了解，很多以前想不明白的问题都能在讲义和公社帖子里找到思路，真的收获满满。强烈推荐需要做分子动力学模拟的朋友都来参加一下培训，对于入门初学还是进阶学习者来说都是一个极好的自我提升机会！ |
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| + 7 | 谢谢 |
| Sob老师非常敬业，输出知识很丰富，本人上过初级量子化学和初级分子动力学模拟的班，收获颇丰。未来需要细嚼慢咽这些知识，希望来年能够继续上中级班和高级班。 |
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| + 3 | 谢谢 |
chands 发表于 2022-8-18 10:13 无关 随便穿的 实际上家里有很多二次元相关的衣服 |
wanghaoyu 发表于 2022-8-18 10:43 培训最后的高级班预告里说了，各种方式的自由能计算（MMPBSA、MMGBSA、TI、FEP、metadynamics等）是高级班内容 |
wanghaoyu 发表于 2022-8-18 10:45 这不是“初级班”。动力学培训没有初级班。当前的培训很多内容都已经属于中级的范畴，诸如VMD tcl脚本编写 理论知识已经讲得很多了，对于实际做分子动力学模拟已经完全够用了。大多数人参加是以应用、解决实际问题为主，所以纯理论知识、背景知识部分不能超过1/3。培训最后的“分子动力学模拟的相关书籍”提供的书单专供希望更多了解分子模拟理论知识的人阅读。有了课上讲的理论知识作为铺垫，再阅读那些书也就不会云里雾里了。 |
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参加过初级量化班，当时收获很大，可以说给我一个不知道如何入门的小白很多的帮助和信息。 这次又参加了初级动力学模拟班级，同样收获不小，但是希望卢老师能更多的讲解一下理论知识，个人对这部分非常感兴趣，觉得卢老师讲解的又透彻。 期待高级动力学班，就是感觉要等很久才能推出～ 最后 膜拜卢老师的精力.... 一瓶水、一台电脑、一身黑衣，上午3h下午5h中间不下课，连续高强度授课实在是牛。 |
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