卡开发发 发表于 2022-9-17 14:30 收到,十分谢谢老师,我试试 ![]() |
本帖最后由 卡开发发 于 2022-9-17 14:34 编辑 zx4562430 发表于 2022-9-16 11:41 1、如果你要稍微可靠一点的结果,其实就用周期边界方法计算就行,400原子其实也不算那么多,siesta和dmol3我之前都做过这么大的CHNO(甚至有些还有Al、Si)体系,甚至可能12核心的老服务器就可以带得动。cp2k我没测试过具体效率,没办法给你建议。 2、你的体系如果确定不会和COF化学吸附,力场质量合适的情况也值得试试,半经验方法优势有限。 3、其实对角化+smear的方式(展宽合适的情况)是什么情况下都能够使用的,根据不同的问题不同展宽形式又有各自的优势;而OT才有上述限定。速度上,大体系通常OT会快一些,因为OT标度会低一些。 |
sobereva 发表于 2022-9-16 23:36 太详细了 谢谢社长大大 |
zx4562430 发表于 2022-9-16 11:41 这些说法不确切 对于某个体系,在二者都可以用的情况下,哪个速度快就用哪个。有时候对角化容易收敛,有时候OT容易收敛,而且还要考虑到对角化和OT每一步的耗时差异对总耗时的影响,以及OT用的preconditioner对耗时和收敛性的影响。GFN-xTB算大体系通常用OT,根据我的经验这是最优选择,也因此Multiwfn创建相应输入文件时默认用OT。 |
sobereva 发表于 2022-9-15 22:20 另外,sob老师,还想请教您下,对于这种cof纯非金属元素体系,使用cp2k计算时,scf收敛算法是选择OT还是对角化,有些说OT算法是黑科技,速度快,因为我们也只考虑了gamma点,有些说对于半导体或绝缘体使用OT算法,对于金属导体使用对角化的方法进行计算,并使用smear方法,这些表述是正确的吗?所以当前cof体系应该采用OT算法,虽然可能GFN1-xTB方法下可能两种scf收敛算法都很快。 谢谢您 |
sobereva 发表于 2022-9-15 22:20 明白了,谢谢sob老师指点,谢谢 |
wangxubo 发表于 2022-9-15 12:12 忘记xtb了,谢谢老师 |
|
建议用CP2K,只考虑gamma点做GFN1-xTB的预优化,然后DFT进一步优化和计算结合能(算结合能时候可以再抠个簇模型出来用量化程序更准确计算,有更多方法可用)。至于CP2K计算时的模型,在平行于COF平面方向用原胞,垂直于COF平面方向平移复制N倍,令小分子和镜像间有足够大的距离。 这个小分子构象空间简单,手动在COF空腔里随意摆5~10个初始位置然后优化即可。不需要做构象搜索。 |
| 拿xtb糊弄糊弄得了 |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2026-2-22 12:17 , Processed in 0.239501 second(s), 25 queries , Gzip On.