北大-陶豫 发表于 2022-9-19 09:11 收到，老师，谢谢。 |
YXY262626 发表于 2022-9-19 09:03 详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入 http://sobereva.com/60 |
sobereva 发表于 2022-9-18 16:52 社长您好，我上次发的帖子算过渡态的时候，您给我说我这个体系除了Pt以外都不要用SDD，请问社长我应该算这个体系过渡态的时候怎样控制PT是SDD，其他原子换一种基组呢？ |
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算分子体系，拿LSDA这么烂的泛函不可能发得了文章 用Lanl2MB这么烂的基组这年头也甭指望发文章 在缺乏理论方法和基组选择常识的前提下绝对不要做计算，否则>99%算出来的是发表不了的垃圾数据，纯粹浪费时间和计算资源 “SOB老师给我说不可以用SDD的方法”我从来没这么说过！ 对于过渡金属配合物的DFT计算，SDD描述金属原子明明是非常常用而且靠谱的 优化过渡态反复不收敛，要么初猜摆得太烂，都优化到没过渡态模样的结构去了，gview里看结构变化便知；要么就是巧合性震荡，仔细看 量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法 http://sobereva.com/164 Gaussian里默认受力小于收敛阈值100倍即便位移没收敛也当成收敛。 另建议看此文 谈谈学量子化学如何正确地入门 http://sobereva.com/355（http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html） |
zjxitcc 发表于 2022-9-18 15:07 收到，感谢老师 |
YXY262626 发表于 2022-9-18 15:04 你导师可能不懂计算，不用管他说的，你自己反复阅读上述博文即可。另外，SDD是基组 不是方法，“LSDA/SDD这种基组和方法算过渡态，SOB老师给我说不可以用SDD的方法”这里面说反了。 不需要你自己摸索计算级别，博文里都讲得很详细。另外，“铂类分子和其他生物分子反应”没有分这么细的。 |
zjxitcc 发表于 2022-9-18 15:01 我们导师一开始叫我用LSDA/SDD这种基组和方法算过渡态，SOB老师给我说不可以用SDD的方法，我想请问一下老师，就是像算铂类分子和其他生物分子反应中间的过渡态结构优化，应该一般采取什么样子的计算级别。实在是麻烦老师了，学生太愚钝了，我也在摸索合适的计算级别。 |
YXY262626 发表于 2022-9-18 14:58 计算级别不合理的话，计算即使收敛了没有意义。所以需要先仔细阅读上述博文 |
zjxitcc 发表于 2022-9-18 14:51 不好意思，老师，您给我推荐的这几个帖子我好多都看不懂，我再仔细看看吧 |
 结构优化没收敛在这个问题中是次要问题，你这方法和基组强烈建议逐篇仔细阅读《简谈量子化学计算中DFT泛函的选择》http://sobereva.com/272 《谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正？”》http://sobereva.com/413 《谈谈量子化学中基组的选择》http://sobereva.com/336 《谈谈赝势基组的选用》http://sobereva.com/373 |
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