计算化学公社»论坛首页 › 计算机软硬件 (Software and Hardware) › 高性能计算、集群、并行技术 (HPC, Cluster, Parallel Computing) › OpenMPI并行计算提示错误

OpenMPI并行计算提示错误

查看数: 2816 | 评论数: 8 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

帖子模式

geyichao

发布时间: 2022-9-19 21:37

正文摘要:

你好，我按量子化学程序ORCA的安装方法 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社 (keinsci.com) 这个链接里的提示，编译安装OpenMPI，以单线程运行ORCA时没有问题的，证明OpenMPI和OR ...

回复 Reply

geyichao 发表于 Post on 2022-9-20 16:31:07

abin 发表于 2022-9-20 16:29
对于vasp orca Dalton 等，
我提供的开箱即用模式，
都默认开启了IB模式的支持，以及其他一些高性能计算 ...

OKOK

abin 发表于 Post on 2022-9-20 16:29:40

对于vasp orca Dalton 等，
我提供的开箱即用模式，
都默认开启了IB模式的支持，以及其他一些高性能计算支持。

能用就好。

记得去ORCA站点多下载几次，为开发者助力。

geyichao 发表于 Post on 2022-9-20 16:26:59

hebrewsnabla 发表于 2022-9-20 16:02
单核运行ORCA没有问题并不能说明openmpi安装没问题（当然我也不是说一定有问题），因为orca可执行程序有两 ...

其实我也觉得问题出在OpenMPI上，但我尝试安装OpenMPI 4.1.1~4.1.4，在编译和安装都成功的情况下，还是有这个问题（ORCA 5.0.3）

hebrewsnabla 发表于 Post on 2022-9-20 16:02:53

单核运行ORCA没有问题并不能说明openmpi安装没问题（当然我也不是说一定有问题），因为orca可执行程序有两份，单核的时候执行的那一份是完全没有调用openmpi的（不安装openmpi也可以运行）

geyichao 发表于 Post on 2022-9-20 15:14:53

abin 发表于 2022-9-20 06:53
如果搞不定的话，搜索我的贴文，
下载即用，无其他依赖。

谢谢。。目前已经使用上您的singularity方案了，暂时没有发现问题。

geyichao 发表于 Post on 2022-9-20 15:14:09

有看到说，在环境变量中加入export OMPI_MCA_btl_openib_if_exclude=mlx4_0:X，其中最后一个数字X与提示的问题描述中的mlx4_0Local port: 一致

参考网站--https://arc.umich.edu/mpi-on-foe

虽然不提示错误了，但有1/3的概率会提示ORCA finished by error termination in SCF错误，感觉像是进程被中止（内存没有超限）。相同的配置文件在其他电脑运行正常。

目前使用楼下abin的singularity方案，暂时没有发现问题。

abin 发表于 Post on 2022-9-20 06:53:35

如果搞不定的话，搜索我的贴文，
下载即用，无其他依赖。

sobereva 发表于 Post on 2022-9-20 01:49:01

把No OpenFabrics connection schemes reported that they were able to be used on a specific port报错放Google里搜

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register