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请问,分析范德华表面穿透程度时,可以定量计算相互穿透区域的体积么?

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ZSW
发布时间: 2022-9-30 09:19

正文摘要:

本帖最后由 ZSW 于 2022-10-1 18:43 编辑 老师,分析范德华表面穿透程度时,除了相互穿透距离之外,还有其他可以定量计算的么?附件中图1是我做的穿透图(F- + CH3CH2Cl体系),亲核试剂和C还有H都有作用,我更想 ...

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ZSW 发表于 Post on 2022-10-9 16:09:52
sobereva 发表于 2022-10-2 04:46
我并不建议从这种角度分析,说不清楚,而且关键也在于和F-作用的并不仅仅是一个原子
还不如讨论结合不同 ...

谢谢老师,我还有一个问题,我想研究离去基团的变化,发生SN2反应时是否会产生严重的空间位阻,我做了SN2过渡态的IRI等值面图,区别不是很明显,老师,有什么方法可以定性或定量描述空间位阻的么?
sobereva 发表于 Post on 2022-10-2 04:46:21
ZSW 发表于 2022-10-1 18:43
谢谢老师,我还有一个问题,图片(已上传)显示的是不同离去基团时,离子偶极子复合物的穿透图,离去基团 ...

我并不建议从这种角度分析,说不清楚,而且关键也在于和F-作用的并不仅仅是一个原子
还不如讨论结合不同取代基时候和F-作用的那个方向的静电势的变化,从物理上也更直接能说明内在的结合倾向、发生的难易程度
ZSW 发表于 Post on 2022-10-1 18:43:38
sobereva 发表于 2022-10-1 12:04
图片直接贴,别放到word文档里,别人还得下载才能看

此时靠穿透距离没法说明跟alpha碳的作用,本来穿透 ...

谢谢老师,我还有一个问题,图片(已上传)显示的是不同离去基团时,离子偶极子复合物的穿透图,离去基团的变化,导致F与α-C之间的穿透程度更大一些,与β-H的穿透程度变化不是很大,此时通过穿透距离或体积是否可以说明离去基团的变化使得F与α-C的相互作用更强?老师关于穿透距离的定义可以推荐下文献么?
sobereva 发表于 Post on 2022-10-1 12:04:27
图片直接贴,别放到word文档里,别人还得下载才能看

此时靠穿透距离没法说明跟alpha碳的作用,本来穿透程度也和F-与带正电的氢的相互作用有显著关系。
穿透体积也不直接体现和alpha碳的作用,体现的是整体的作用。但需要算的话我可以在Multiwfn里加上相应功能

不用在意形状,没啥问题。此特征和Cl的价电子结构有关

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