关于msi2lmp将Ms转换成lammps需要的data文件

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发布时间: 2022-10-3 22:15

各位大神，我在使用lammps计算石墨与三氟甲烷反应的问题时，使用Material Studio生成car和mdf文件后使用msi2lmp转换成data的过程中出现以下问题该怎么解决呢？图1是我建的弄你盒子，以下是我的问题： WARNING incon ...

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Deathaliveone 发表于 Post on 2022-10-29 13:50:32

keyanxiaobai 发表于 2022-10-10 20:06
如想通过虚拟机看看反应的运动轨迹需要区分元素吗

只要是C元素在同一个反应力场都是直接调用的，如果区分的话吗、，后处理可视化卡哇伊看到不同颜色的C，其他应该没影响。你喜欢的话可以手动都改成一种C

ZZU_SCU 发表于 Post on 2022-10-10 10:49:46

keyanxiaobai 发表于 2022-10-9 22:26
反应力场是不是不能区别两种C的类型呀

还是区分元素的好，结合dump_modify命令，在VMD可以被识别，后处理比较方便详见 http://bbs.keinsci.com/thread-29714-1-1.html

cyx98 发表于 Post on 2022-10-10 10:20:03

keyanxiaobai 发表于 2022-10-9 22:26
反应力场是不是不能区别两种C的类型呀

不区分，就是看你后处理的时候需不需要区分。需要的话，用group命令

cyx98 发表于 Post on 2022-10-4 10:58:42

如果不区分石墨和三氟甲烷上的C，在MS里atom selection把C的forcefield type全部设置为c

ZZU_SCU 发表于 Post on 2022-10-3 22:33:04

#号后的内容不会识别的，不用修改

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