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只用IRC可以验证过渡态的正确性吗

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发布时间: 2016-5-13 23:16

正文摘要:

本帖最后由 believeht 于 2016-5-13 23:21 编辑 QST2的方法寻找过渡态,用A1、B1作为初始构型找到TS1,用A2、B2作为初始构型找到TS2。这样做IRC验证时,是不是两条路径都指向A、B? 如果是的话,该如何验证找到 ...

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believeht 发表于 Post on 2016-5-16 08:22:17
liyuanhe211 发表于 2016-5-15 23:39
我个人认为确实应当找到势能面上底物和产物周围的全部(大部分)鞍点才能【确证】找到的路径是正确的,但 ...

Thanks,
liyuanhe211 发表于 Post on 2016-5-15 23:39:13
believeht 发表于 2016-5-15 23:20
谢谢liyuanhe211
中间画的是极大点,忘了标了…
对于你的答案,我的理解是用QST2方法寻找过渡态,假如 ...

我个人认为确实应当找到势能面上底物和产物周围的全部(大部分)鞍点才能【确证】找到的路径是正确的,但是目前很难实现。

“全势能面扫描”显然没有必要、提这个说法就像说每个体系都应该做FCI/CBS才能算出准确能量一样只是个乌托邦,用一些算法似乎也能得到两个稳定点之间的主要鞍点,如GRRM,不过目前也实用性不强。所以去“【确证】找到的路径是正确”是十分困难的,且通过化学知觉去猜很多过渡态,辅之以IRC已经有较高的正确率,甚至很多体系承受不了计算消耗,直接只做个频率看一下震动模式正确也可以;甚至有些体系频率都做不起,看一下键长也凑合。只不过是对不同困难程度的问题采用了不同的置信度罢了。

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believeht 发表于 Post on 2016-5-15 23:20:05
liyuanhe211 发表于 2016-5-14 00:36
我的理解:
如果你中间画的是个极小点IM,则favor的反应路径是A--IM--B,TS1和TS2都有不止一个虚频,不是 ...

谢谢liyuanhe211
中间画的是极大点,忘了标了…
对于你的答案,我的理解是用QST2方法寻找过渡态,假如找到一个过渡态,要做全势能面扫面才能确定是不是只有一个过渡态,以及找到的这个是不是正确。不知道这样理解对不对,但上述验证的方法貌似计算量大得行不通。
有的帖子(比如http://sobereva.com/44第3.4节)或很多文献(不列举了)中,只提到为了验证过渡态的正确性,用IRC来验证。那是不是说明有的反应一看就知道只有一个过渡态,然后验证一下连接反应物和产物就可以。(可能上面这句话说得比较没水平,但我觉得应该有普适性)
liyuanhe211 发表于 Post on 2016-5-14 00:36:37
本帖最后由 liyuanhe211 于 2016-5-14 00:55 编辑

我的理解:
如果你中间画的是个极小点IM,则favor的反应路径是A--IM--B,TS1和TS2都有不止一个虚频,不是正确的过渡态。

如果你中间画的是个极大点(二阶鞍点),则表明以优化过的底物和产物(A和B)用QST2可能并不能得到TS,类似HCN --> CNH的过程,非要用QST2需要人为破坏线性对称性。

以及势能面上的两个极小之间有多个(可以能量不同的)TS并不奇怪,例如 HCN --> CNH 就有一圈都是对的。理论上应该找到最低的TS,或找到多个TS做分布。

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