求助:跑ACN液体，密度图像很奇怪

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发布时间: 2022-10-12 20:18

各位老师好，新手求帮助，跑乙腈ACN学习gromacs使用时，使用avogadro生成的分子，力场文件是根据文献自己写的，mdp文件是用的教程里的。奇怪之处在于都是同样的文件，第一次跑出来的密度经过短时间即可收敛于正 ...

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sobereva 发表于 Post on 2022-10-13 13:59:55

拓扑文件莫名其妙，乙腈的[moleculetype]都没体现出来
甭用那么大的tau-t和tau-p。体系平衡前甭用N-H热浴和PR压浴，这都是动力学基本常识
上传的所有文件都自觉标清楚每个是什么

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