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为什么这个2中心键做不出来AdNDP轨道?

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发布时间: 2022-10-13 10:15

正文摘要:

AdNDP分析,蓝圈的地方,直觉那里应该有2中心键,但死活都找不出来。哪位大神能帮我做一下。该键的键级为0.87,其他在边缘的键级都在1.1--1.5之间,但LOL图那个地方密度很高,这该怎么解释呢? 输入文件 ...

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aaq2800 发表于 Post on 2022-10-14 15:57:51
sobereva 发表于 2022-10-14 14:00
进AdNDP界面后,选1 Perform orbitals search for a specific atom combination,然后输入1,15,就会找出 ...

好的,我知道怎么处理了,万分感谢社长。
sobereva 发表于 Post on 2022-10-14 14:00:30
aaq2800 发表于 2022-10-14 12:56
输入文件我已上传到顶帖,辛苦社长。又做了几次,即便不取一中心的孤对电子,那个地方依然没有二中心。查 ...

进AdNDP界面后,选1 Perform orbitals search for a specific atom combination,然后输入1,15,就会找出一堆双中心轨道

...略
#  16 Occ: 0.0010 Atom:   1B   15B
#  15 Occ: 0.0012 Atom:   1B   15B
#  14 Occ: 0.0022 Atom:   1B   15B
#  13 Occ: 0.0033 Atom:   1B   15B
#  12 Occ: 0.0041 Atom:   1B   15B
#  11 Occ: 0.0051 Atom:   1B   15B
#  10 Occ: 0.0216 Atom:   1B   15B
#   9 Occ: 0.0267 Atom:   1B   15B
#   8 Occ: 0.0490 Atom:   1B   15B
#   7 Occ: 0.2101 Atom:   1B   15B
#   6 Occ: 0.5545 Atom:   1B   15B
#   5 Occ: 0.6949 Atom:   1B   15B
#   4 Occ: 0.9647 Atom:   1B   15B
#   3 Occ: 0.9728 Atom:   1B   15B
#   2 Occ: 1.1945 Atom:   1B   15B
#   1 Occ: 1.6075 Atom:   1B   15B

选8 Visualize candidate orbitals and molecular geometry,然后查看1号候选轨道,如下所示,可见正常找出了双中心轨道


由于其占据数较低,而且定域化轨道也判断出1-15-16有三中心轨道,因此应当考虑去搜索三中心轨道。如果现在就把这双中心轨道挑出来,本来比较理想的三中心轨道以后就挑不出来了。

aaq2800 发表于 Post on 2022-10-14 12:56:05
本帖最后由 aaq2800 于 2022-10-14 13:05 编辑
sobereva 发表于 2022-10-14 12:20
给Multiwfn用的输入文件都压缩后贴出来

输入文件我已上传到顶帖,辛苦社长。又做了几次,即便不取一中心的孤对电子,那个地方依然没有二中心。查看定域化占据轨道,该位置只有一个三中心轨道
sobereva 发表于 Post on 2022-10-14 12:20:21
aaq2800 发表于 2022-10-14 11:39
在2中心之前,一中心 选了2个Co原子的孤对电子

给Multiwfn用的输入文件都压缩后贴出来
aaq2800 发表于 Post on 2022-10-14 11:39:44
sobereva 发表于 2022-10-14 11:01
说清楚具体操作
不可能阈值设到极低还找不出来。找之前先别找其它的轨道

在2中心之前,一中心 选了2个Co原子的孤对电子
sobereva 发表于 Post on 2022-10-14 11:01:56
aaq2800 发表于 2022-10-14 07:49
sob老师好,一个一个的取还是找不出来。该键的Mayer键级为0.87,而其他在边缘的键级都在1.1--1.5之间

说清楚具体操作
不可能阈值设到极低还找不出来。找之前先别找其它的轨道
aaq2800 发表于 Post on 2022-10-14 07:49:44
sobereva 发表于 2022-10-13 12:43
参考下文,用Multiwfn绘制ELF、产生定域化轨道,或者算Mayer键级,考察那里到底是否真的有高定域性区域,没 ...

sob老师好,一个一个的取还是找不出来。该键的Mayer键级为0.87,而其他在边缘的键级都在1.1--1.5之间
aaq2800 发表于 Post on 2022-10-13 13:01:53
sobereva 发表于 2022-10-13 12:43
参考下文,用Multiwfn绘制ELF、产生定域化轨道,或者算Mayer键级,考察那里到底是否真的有高定域性区域,没 ...

好的社长,我再深入分析一下
sobereva 发表于 Post on 2022-10-13 12:43:18
参考下文,用Multiwfn绘制ELF、产生定域化轨道,或者算Mayer键级,考察那里到底是否真的有高定域性区域,没有的话也别指望能找出高占据的AdNDP轨道
使用Multiwfn通过LOBA方法计算氧化态
http://sobereva.com/362http://bbs.keinsci.com/thread-5118-1-1.html

Multiwfn里搜索AdNDP轨道可以直接指定考虑的原子序号范围,以及占据数阈值,下文都说了。就算二者之间共享电子程度很弱,也照样能给搜出来双中心轨道,只不过占据数会非常低
Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比
http://sobereva.com/380http://bbs.keinsci.com/thread-6053-1-1.html

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