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求助有关AIMD前期“热处理”或“热化”的问题

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YUX

发布时间: 2022-10-15 18:52

正文摘要:

各位老师好，目前正在学习cp2k和plumed联用的元动力学，但是有些细节还非常模糊，读到了这样的两篇文章，都是对矿物在水溶液中的溶出过程进行研究，我也想模仿他们的思路研究某种矿物在水溶液中的行为。但是目前存在 ...

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YUX 发表于 Post on 2022-10-15 19:43:10

sobereva 发表于 2022-10-15 19:30
1 所谓的热化就是在热浴下模拟一定时间，令体系在某个温度下达到平衡。作者假定2.5或5ps可以达到平衡，更严 ...

好的，非常感谢sob老师的解答！

sobereva 发表于 Post on 2022-10-15 19:30:28

1 所谓的热化就是在热浴下模拟一定时间，令体系在某个温度下达到平衡。作者假定2.5或5ps可以达到平衡，更严格来说应当检验密度、势能等量的变化，参看
谈谈怎么判断分子动力学模拟是否达到了平衡
http://sobereva.com/627（http://bbs.keinsci.com/thread-27122-1-1.html）

2 合理

3 sigmaplot、matplotlib等，就是个普通的二维填色图，恰当设置色彩刻度就完了

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