求醋酸根离子的lennard-Jones参数

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发布时间: 2016-5-18 09:00

求醋酸根离子的lennard-Jones参数，在水溶液中是作为一个整体来算还是每个原子都要考虑？真的不懂，算出的结果想做为第一性原理分子动力学的起始坐标。

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2016-5-18 21:05:46

laifeng20151107 发表于 2016-5-18 14:46
谢谢sob老师的解答，那么如果溶液中有Cu+，是不是Cu与体系中每个原子的作用都要考虑进去。

是

laifeng20151107 发表于 Post on 2016-5-18 14:46:58

sobereva 发表于 2016-5-18 10:39
考虑水溶液显然是每个原子都要考虑。所以你得有醋酸根离子每个原子与水的O和H之间的LJ参数。按照混合规则， ...

谢谢sob老师的解答，那么如果溶液中有Cu+，是不是Cu与体系中每个原子的作用都要考虑进去。

sobereva 发表于 Post on 2016-5-18 10:39:56

考虑水溶液显然是每个原子都要考虑。所以你得有醋酸根离子每个原子与水的O和H之间的LJ参数。按照混合规则，如果你的力场里已经有了醋酸根离子每个原子LJ参数，并且也指定了水模型，这些原子间LJ参数自然而然就有了。

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