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使用lammps计算reaxff时，发现分子仅仅是连接成块，不符合化合价成键断键

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keyanxiaobai

发布时间: 2022-10-19 17:41

正文摘要:

各位大神我在使用lammps计算reaxff时，使用vmd观看轨迹发现分子仅仅是连接成块，不符合化合价成键断键，是什么原因呢？

回复 Reply

jrfjrf123 发表于 Post on 2022-11-3 02:34:55

keyanxiaobai 发表于 2022-10-29 23:19
请问可以查找力场的网址有哪些呀

可以先看这个网页：

https://www.scm.com/doc/ReaxFF/Included_Forcefields.html

但可能没有最新的

keyanxiaobai 发表于 Post on 2022-10-29 23:19:41: 提示: 作者被禁止或删除内容自动屏蔽

jrfjrf123 发表于 Post on 2022-10-28 23:25:34

找文献换一个力场或者自己拟合一个力场

但后者挺难的，我也不会

一般找一个和自己体系接近的力场

keyanxiaobai 发表于 Post on 2022-10-28 20:24:47: 提示: 作者被禁止或删除内容自动屏蔽

jrfjrf123 发表于 Post on 2022-10-28 14:57:10

是只出现一瞬间还是持续存在？C-F键的模拟键级很接近一吗

如果只是短时间出现属于是偏差，如果长时间出现且键级很高，那就是力场问题了

keyanxiaobai 发表于 Post on 2022-10-28 11:36:01: 提示: 作者被禁止或删除内容自动屏蔽

keyanxiaobai 发表于 Post on 2022-10-27 14:14:36: 提示: 作者被禁止或删除内容自动屏蔽

jrfjrf123 发表于 Post on 2022-10-27 02:16:51

看一帧的结构基本上得不到有用的信息

reaxff 基于键价的动态计算，没有固定的键结构，所以有时候会出现很奇怪的分子结构（比如+2价的C），可以认为是那一瞬间的过渡态结构（虽然实验上不一定有）

得用reaxff/bond 命令来统计一段时间内的基于cutoff计算的成断键信息才有说服力

而且很多反应在这个时间尺度上很难发生，得升温到很高温度，这又导致了这些奇怪结构出现的可能

以上只是我个人见解，如果有错误欢迎指正

keyanxiaobai 发表于 Post on 2022-10-26 17:33:44: 提示: 作者被禁止或删除内容自动屏蔽

sobereva 发表于 Post on 2022-10-19 22:21:58

看不懂你的意思。如果是期望的成键断键的反应没有发生，可能模拟条件不对，或者跑的时间不够等原因

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