本帖最后由 熊小熊 于 2022-10-25 16:05 编辑 白夜 发表于 2022-10-24 22:07 嗯！非常感谢您的回复  。我等距离取的方式是,每个conf.gro都对应一个距离，然后我就根据这个距离选取对应的conf.gro文件，例如，距离3.82对应的是conf0.gro，然后取3.62对应的conf.gro，3.42对应的conf.gro,您一般 采取什么的方式采样呢？ 如果按照您说的以半峰为标准，在模拟每个窗口时是不是设置的时间就会有出现差异。 |
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本帖最后由 白夜 于 2022-10-24 22:11 编辑 看不懂你怎么等距离取的窗口，我说一下我的 取窗口，两研究对象相聚越近，所需窗口越密集，我用的是0.2a一个窗口（距离小于5a），0.5a一个窗口（距离大于5a） hist图可以理解为数量图，对映的是自由能图中不同位置的倾向，hist中曲线聚集说明自由能能阱，反之能垒 根据hist两曲线重叠度来选择合适时间，时间越长，两峰重叠点越高（我以半峰高为标准），也可以降低弹簧力（降低峰高，增加峰宽） |
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