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fukui函数测亲电性问题

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发布时间: 2016-5-20 17:04

正文摘要:

sob老师,我想再请教下关于fukui函数测算亲电性,亲核性的具体。我已经可以测算出N,N+1,N-1分子对应的每个原子的Hirshfeld电荷,但是我不清楚您给的图中f-,f+底下对应的每个原子的Hirshfeld电荷是怎么来的(下图红 ...

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sobereva 发表于 Post on 2019-12-22 00:36:09
liuyjhx 发表于 2019-12-21 14:32
老师为了更准确我可以用b3lyp/genecp优化出来的结构,然后把N,N-1状态下都在b2plypd3/def2tzvp 基组下计 ...

没意义
算电子能量更准的不代表算的波函数也更准,何况波函数分析对波函数质量要求并不高,用普通泛函足够了。而且本来Gaussian算双杂化就很慢,产生双杂化的密度更耗时
liuyjhx 发表于 Post on 2019-12-21 14:32:26

老师为了更准确我可以用b3lyp/genecp优化出来的结构,然后把N,N-1状态下都在b2plypd3/def2tzvp 基组下计算单点能来考查亲电位点吗?
QuantumHan 发表于 Post on 2018-4-27 20:44:44
sobereva 发表于 2018-4-24 17:09
#p m062X/6-311+G(d,p) opt freq优化N,直接就得到了N.fch
然后再用N.fch保存成新的.gjf文件,设成N-1 ...

谢谢老师的指导。
sobereva 发表于 Post on 2018-4-24 17:09:58
QuantumHan 发表于 2018-4-24 15:16
老师不好意思,我没表述清楚。我是想问,优化用的#p m062X/6-311+G(d,p) opt freq . 将优化后的N和N-1两 ...


#p m062X/6-311+G(d,p) opt freq优化N,直接就得到了N.fch
然后再用N.fch保存成新的.gjf文件,设成N-1状态的单点任务,还是用m062X/6-311+G(d,p),算完了就有了N-1.fch。通过这俩fch求差得到福井函数。
没必要用后HF。电子密度相关的量对计算级别敏感度远远低于能量。
QuantumHan 发表于 Post on 2018-4-24 15:16:37

老师不好意思,我没表述清楚。我是想问,优化用的#p m062X/6-311+G(d,p) opt freq . 将优化后的N和N-1两个文件保存成两个单点输入文件,这两个计算单点能否还是仍用#p m062X/6-311+G(d,p)呢,还是需要提升一个级别比如用双杂化泛函?因为在算势能面能垒的时候用的后HF方法,而后HF方法计算又显得比较昂贵,只是想得到这个N-1的.chk文件作分析
sobereva 发表于 Post on 2018-4-24 14:19:20
QuantumHan 发表于 2018-4-24 12:06
借楼主问的Fukui函数预测反应亲电性的问题再请教下Sob老师。博文http://sobereva.com/402这段有些迷糊。。 ...


需要一致
QuantumHan 发表于 Post on 2018-4-24 12:06:54
借楼主问的Fukui函数预测反应亲电性的问题再请教下Sob老师。博文http://sobereva.com/402这段有些迷糊。。先在Gaussian中在B3LYP/6-31G*下优化中性状态的晕苯,将得到的chk文件转换为fch后命名为N.fch。然后基于优化的中性的晕苯的结构,将电荷和自旋多重度改为1 2(即+1阳离子态),算个单点任务(切勿做优化任务),将得到的chk转换并命名为N-1.fch
单点计算N-1的时候基组可以与输入文件为N时的一致么,只是不优化。比如输入文件为N时用的#p m062X/6-311+G(d,p) opt freq   N-1时直接写 #p m062x/6-311+G(d,p),还是得算单点能提高一个级别才可行呢?谢谢老师
miya 发表于 Post on 2016-5-30 15:22:31
sobereva 发表于 2016-5-29 18:26
你载入N-1和N+1状态的.wfn文件,按照手册4.7节的例子就算出电荷来了,超级容易
会算中性的不可能不会 ...

谢谢sob老师,搞定啦
sobereva 发表于 Post on 2016-5-29 18:26:50
miya 发表于 2016-5-29 17:05
又打搅了sob老师,我看了,但是没有写出怎么得到对应的具体原子N-1,N+1状态下的Hirshfeld电荷,我也翻了 ...


你载入N-1和N+1状态的.wfn文件,按照手册4.7节的例子就算出电荷来了,超级容易
会算中性的不可能不会算离子态的,操作过程完全一样,仅输入文件不一样而已
miya 发表于 Post on 2016-5-29 17:05:02
sobereva 发表于 2016-5-20 23:04
看手册4.7.3节的例子

又打搅了sob老师,我看了,但是没有写出怎么得到对应的具体原子N-1,N+1状态下的Hirshfeld电荷,我也翻了下4.5.4节,也没有发现额,求老师可以具体一点么,我卡在这块了
sobereva 发表于 Post on 2016-5-20 23:04:44
看手册4.7.3节的例子

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