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求助如何解决VOTCA的csg模块无法读取gromacs的.tpr拓扑文件的情况 (已解决)

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jrfjrf123

发布时间: 2022-10-27 02:40

正文摘要:

本帖最后由 jrfjrf123 于 2022-10-29 02:14 编辑大家好，我最近想使用VOTCA生成粗粒力场，用的gromacs作为全原子信息的模拟软件。 Gromacs版本是2022年9月份的版本，VOTCA也是使用的最新版。在使用 ...

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phyllis11 发表于 Post on 2024-10-30 10:28:32

您好，我最近也在学习使用VOTCA,请问可以交流一下吗？

zhy336613 发表于 Post on 2023-8-1 19:50:02

你好，我猜测两种方法可行。1）编译时加上-DBUILD_OWN_GMX=ON，让votca自行构造一个gmx供他使用；2）安装gmx时加上-DGMX_INSTALL_LEGACY_API=ON，编译votca时引用gmx的目录，-DGROMACS_DIR=/where/you/install/gmx/。csg必须在2019.6及以前版本的gmx支持下运行。

jrfjrf123 发表于 Post on 2022-10-27 18:35:40

请问有人知道这个问题如何解决吗

jrfjrf123 发表于 Post on 2022-10-27 11:46:31

依旧是有如下显示：

csg_stat --top topol.tpr --trj traj.trr --cg hexane.xml --nt 6 --options settings.xml

begin to calculate distribution functions
# of bonded interactions: 2
# of non-bonded interactions: 3
an error occurred:
Error 'tpr' file format of file 'topol.tpr' cannot be read or written

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