组氨酸与羟基的质子化问题求助

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发布时间: 2022-10-27 21:21

求助一下各位一个基本问题，一个组氨酸，咪唑环质子化的N原子还能与羟基形成氢键么？如图所示。

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sobereva 发表于 Post on 2022-10-28 06:49:59

可以把咪唑环上多余的基团截掉，然后找个甲醇之类带羟基的简单体系几何优化看看
有可能N上的H与羟基氧形成氢键倾向性更强，导致N和H之间没氢键出现。而且羟基氢和咪唑环另一边的氮有很强的氢键形成倾向。要考虑氢键形成的竞争关系

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