s345538842 发表于 2022-11-8 21:30
Using xTB with Orca
Orca 4.2 implements support for xTB calculations using an IO based interface  ...

你好，请问你使用Amber+ORCA+XTB做QM/MM MD的效率是多少呢？我170个原子的QM区域，每帧耗时约一秒，一天只能算不到200皮秒。我发现XTB的并行效率似乎很低，40核比起单核速度只提高到不到两倍。而且如果ORCA也指定多线程，疑似会和XTB发生线程冲撞导致负优化，需要用单核的ORCA然后手动指定XTB多线程。

s345538842 发表于 2022-11-8 21:30
Using xTB with Orca
Orca 4.2 implements support for xTB calculations using an IO based interface  ...

谢谢，就是xtb没有被识别的原因

wangyongchaocc 发表于 2022-11-7 12:00
附件图片

Using xTB with Orca
Orca 4.2 implements support for xTB calculations using an IO based interface calling the xtb binary and parsing its output.

The binaries of Orca will call an executable called otool_xtb, which should be placed in the directory containing the Orca binaries. We recommend to create a symbolic link to your local xtb binary by

> ln -s $(which xtb) otool_xtb


https://xtb-docs.readthedocs.io/ ... using-xtb-with-orca

可能是楼上说的问题，xtb没被识别到

wangyongchaocc 发表于 2022-11-7 09:58
关于orc_job.tpl，放在了当前的文件夹，里面也写了！ xtb2。但是很明显他没有读取到这个文件，而是直接采 ...

首先要确保安装Orca/xtb，能够让Orca直接使用GFN2-xTB的方法，之后再去用Amber/Orca试试。我感觉是权限的问题。

附件图片

您好，解决了orca调用xtb的问题，但是运行了一圈，old.orc_job.dat提示收敛成功，单第二圈新的orc_job.dat 就又报错了。

s345538842 发表于 2022-11-7 09:49
orc_job.tpl  放在in文件的当前文件夹，关于调用xtb群里 论坛里 有很多人 说过

关于orc_job.tpl，放在了当前的文件夹，里面也写了！ xtb2。但是很明显他没有读取到这个文件，而是直接采用了HF的方法。xtb的调用我再找找，不清楚为啥.tpl没有被读取到。

wangyongchaocc 发表于 2022-11-7 09:41
你好，请问，你用amber跑qm/mm时，orc_job.tql时放在什么位置啊，不清楚为什么我运行时，没有读取到.tpl文 ...

orc_job.tpl  放在in文件的当前文件夹，关于调用xtb群里 论坛里 有很多人 说过

你好，请问，你用amber跑qm/mm时，orc_job.tql时放在什么位置啊，不清楚为什么我运行时，没有读取到.tpl文件。另外想问一下，你的orca调用xtb的具体方式。我这使用软连接没有成功。