ZHIMING123 发表于 2022-11-1 14:38
你好，老师，想问下您有无单个小分子的动力学教程？我看官网是水中蛋白的，我想只跑一个小分子。

把其它部分都去了就完了

如果对拓扑文件的概念一塌糊涂，连这都不知道怎么正确处理，建议参加北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）系统性学一遍，就全明白了

sobereva 发表于 2022-11-1 05:26
http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8

你好，老师，想问下您有无单个小分子的动力学教程？我看官网是水中蛋白的，我想只跑一个小分子。

http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “NVT 小分子处理” 改了，以后务必注意，下次将删帖+扣分处理。