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求助:PBS提交VASP效率异常变低

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发布时间: 2022-11-1 12:36

正文摘要:

本帖最后由 含光君 于 2022-11-1 12:45 编辑 各位老师好: 最近我在编译VASP 6.3.0+vaspsol+VTST完毕后,运行make test可正常结束。vaspsol与VTST功能均可正常实现。但实际使用时发现,若使用PBS提交任务(调用5 ...

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含光君 发表于 Post on 2022-11-1 21:57:35
2楼正解!
abin 发表于 Post on 2022-11-1 16:12:01
又是一个超线程受害者。
要么合理配置调度器,
要么关闭超线程。
含光君 发表于 Post on 2022-11-1 15:40:38
万里云 发表于 2022-11-1 15:06
这种每个进程CPU占用超过100%的,一般是编译时开了OpenMP,又没有正确设置线程数。

在脚本里把OMP_NUM_T ...

谢谢解答!我去尝试一下!
万里云 发表于 Post on 2022-11-1 15:06:06
这种每个进程CPU占用超过100%的,一般是编译时开了OpenMP,又没有正确设置线程数。

在脚本里把OMP_NUM_THREADS和MKL_NUM_THREADS设置成1试试。

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