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请问怎么对IGMH结果中的氢键和范德华吸引作用定量分析？

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yang2020

发布时间: 2022-11-7 00:53

正文摘要:

Sob老师以及论坛中的各位老师晚上好，最近我使用IGMH分析了吸附主客体之间的作用类型，得到了蓝绿色等值面图。我认为蓝色是氢键作用，绿色是范德华吸引，这是从肉眼定性分析得到的，我想问的是可以定量地分析出这两 ...

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yang2020 发表于 Post on 2022-11-7 11:07:28

牧生发表于 2022-11-7 08:25
氢键，范德华作用，并没有严格的界限，很弱的氢键，在igmh分析中，也可能表现为绿色，只要长度和角度符合氢 ...

谢谢老师解答

yang2020 发表于 Post on 2022-11-7 11:06:54

sobereva 发表于 2022-11-7 10:04
不要过度解释边缘的绿色区域。那是因为那种地方电子密度很低所以才显示出绿色，显然当前要关注的是相互作用 ...

嗯呐，谢谢sob老师解答

yang2020 发表于 Post on 2022-11-7 11:05:51

wzkchem5 发表于 2022-11-7 02:12
这个一般要靠能量分解分析。至于有没有办法纯粹从IGMH结果做定量分析我就不清楚了，但估计即使这种方法存在 ...

谢谢老师解答

sobereva 发表于 Post on 2022-11-7 10:04:24

不要过度解释边缘的绿色区域。那是因为那种地方电子密度很低所以才显示出绿色，显然当前要关注的是相互作用轴线区域的颜色
这是典型的氢键，相对于氢键来说范德华作用完全可以忽略不计

另外，强烈建议参看此文里的讨论
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度：一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
http://sobereva.com/513（http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html）

牧生 发表于 Post on 2022-11-7 08:25:27

氢键，范德华作用，并没有严格的界限，很弱的氢键，在igmh分析中，也可能表现为绿色，只要长度和角度符合氢键时，也认为是氢键。
你这个图中，是吸引力，不用看边缘的绿色

wzkchem5 发表于 Post on 2022-11-7 02:12:35

这个一般要靠能量分解分析。至于有没有办法纯粹从IGMH结果做定量分析我就不清楚了，但估计即使这种方法存在也不如用能量分解分析的做法更普遍

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