皮蛋超人 发表于 2024-12-10 11:54 可以直接在data文件里定义一个原子,把电荷设置为0就行 或者用set命令设置指定id的原子的电荷为0 ![]() |
jrfjrf123 发表于 2022-11-8 13:21 请问,LAMMPS添加零电荷的刚体球怎么设置啊{:' 谢谢您 |
jiminfu 发表于 2022-11-9 12:13 谢谢您的解答。万分感谢 |
bluewhale 发表于 2022-11-9 07:39 谢谢您的解答。万分感谢 |
wzkchem5 发表于 2022-11-9 05:34 谢谢您的解答。万分感谢! |
耿无敌 发表于 2022-11-8 21:15 Lammps 里面有fix indent命令,可以设置 sphere,cylinder,plane等多种形状,具体看手册 |
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纳米压痕使用fix indent命令,可设置压痕力、纳米球位置、半径以及纳米球下压的速度。 |
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金刚石表面一般是被氢原子(视金刚石制备方法而定,有时可能是羟基)饱和的,不能直接从金刚石晶胞里切一块拿来就用,要把边缘饱和。不然你想想,一整个表面都是碳自由基,当然会和纤维素反应。 |
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jrfjrf123 发表于 2022-11-8 13:20 谢谢你的回复,我是在Material studio进行建模,在lammps进行模拟的。请问lj/expand势 涉及到分子的范德华力、库仑力、氢键吗? |
不太清楚你用的模拟软件, 不过如果是lammps的话直接添加一个电荷为0,使用lj/expand势且只存在排斥势 (通过设置cutoff值) 的刚体球就不会有图一这种吸引的情况了 gromacs应该也可以实现,不过不知道怎么做 |
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不太清楚你用的模拟软件, 不过如果是lammps的话直接添加一个电荷为0,使用lj/expand势且只存在排斥势 (通过设置cutoff值) 的刚体球就不会有图一这种吸引的情况了 gromacs应该也可以实现,不过不知道怎么做 |
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