| 可以参考这里。http://sobereva.com/506 这个当然跟温度有关。低温下有些势垒不容易过,高温下就容易了。 |
tonganlhy 发表于 2025-2-14 18:07 那请问判断是不是容易转换有个经验能垒高度不? 以及需要考虑不同反应温度吗? |
| 这样的就会根据能垒进行分配了,具体可以参考平行反应。原来图的问题主要是int1和int3转换太容易,所以变成sink了 |
wzkchem5 发表于 2022-11-9 14:49 老师好,请问如果Int2的能量不是这么低但也没有比TS6还高,比如是10,或者接近TS6的值15,此时应该如何考虑呢? |
wzkchem5 发表于 2022-11-9 14:49 是的。int2其实是分界岭,目前从楼主这个图来看,int1 很容易经过int2转化成int3,所以,我认为,参考点就是int3。这里有个前提,就是三个中间体之间没有很夸张的能垒阻隔,三者的转换比较容易进行 |
冰释之川 发表于 2022-11-9 02:28 参考点导致能垒趋势反转的例子确实有,但楼主这个例子里面不会反转。 如果把Int2抬到比TS6还高,那就反转了,从Int1出发主要走pathway 2,从Int3出发主要走pathway 1。 |
本帖最后由 冰释之川 于 2022-11-9 11:54 编辑 fhh2626 发表于 2022-11-9 10:55 我明白你的意思,参考零点的平移是不会改变计算结果,你说的没错。 以int1作为起点的时候,而path2 是 int1 -> TS6 -> int7, 而path1其实是分成两个阶段:阶段1:int1 -> int2 ->int3. 阶段2: int3 -> TS4 -> int5; 这时候要用判断决速步是哪个阶段,明显是阶段2,所以,计算决速步能垒的时候反应物选择int3来计算,这时候就会碰到你说的“苹果与橘子比较”的问题了,算出的结果会不太一样。
总之,我完全赞同你说的“苹果与苹果比较”的计算结果,即大家算能垒,都是用同一个参考点直接算,不划分反应阶段,结论完全没问题,而且只要大家都是相对同一个参照点算“差值”,就算参照点上下移动,只要两个过渡态相对位置不变,结论永远不会变。 之前我的表述可能引起了极大的误会,在这里表示歉意。 他这个反应,其实就应该是2楼苹果老师说的,要以int3为参考点(分布最多,最稳定),这时候,你分别计算两个过渡态的能垒的时候,大家都是以int3为“减数”,所以path1是优势路径。 (没想到一个帖子会引来这么多讨论哈,真是难得啊O(∩_∩)O) |
冰释之川 发表于 2022-11-9 09:56 或者你可以以potential energy surface的角度上来理解,A鞍点比B高,这是一个客观事实,与你站在哪个地方观察是无关的。不管你从哪里出发,爬上A鞍点,克服重力势能所做的功就会比爬上B鞍点要高,这与A和B之间是否存在一个坑无关
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冰释之川 发表于 2022-11-9 09:56 能垒不是按你这么算的,相对比较时不用考虑是否存在比参考零点更低的态。 如果int3的能量是负无穷大,那从int1到int3时就会得到无穷大的能量,所以TS4和TS6相对高度是永远不变的 we compare apples to apples, not apples to oranges |
fhh2626 发表于 2022-11-9 09:49 赞同,不管以哪个为参考点,路径1都更有利。 参考点要保持不变,不能路径1以Int3为参考点,路径2又以Int1为参考点,那肯定判断错误 |
本帖最后由 冰释之川 于 2022-11-9 10:05 编辑 fhh2626 发表于 2022-11-9 09:49 我这里说的参考零点并不一定是指代过渡态要减去的那个参考零点,因为这路径中可能会有比参考零点更低的态。 Int1为参考点,TS4高度为19,TS6高度为15 这里要注意:因为int1很容易转为能量更负的int3,就算以int1为参考零点,实际计算的时候还是得以int3作为反应物。 其实你可以假想一下,如果int3的能量是负无穷大,那这个反应路径基本上就断了,你所计算的TS4高度为11其实是假的,是错觉 |
冰释之川 发表于 2022-11-9 09:28 哈? Int1为参考点,TS4高度为11,TS6高度为15 Int3为参考点,TS4高度为19,TS6高度为23 |
| 我也没有看懂,int0在哪里? |
本帖最后由 冰释之川 于 2022-11-9 09:33 编辑 fhh2626 发表于 2022-11-9 09:16 对于能垒的计算,参考点不一样,有可能会导致两个路径的能垒相对大小发生反转,你看看分别以int1与int3(更稳定)为参考点,来计算能垒的结果 其实,这里主要要考虑int1与int3分布问题,显然int3的分布要高很多,参考点应该选int3 |
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