VMD如何设置绘图

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发布时间: 2022-11-9 16:29

各位老师，我构建了一个石墨烯炭吸附剂，吸附有机小分子的模拟体系。1.请问如何用VMD绘图才能显示成这两个图的样子呢？ 2.各位有更好的绘制效果吗？既能看到炭结构又能观察邮寄小分子的吸附状态。

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2022-11-9 20:10:21

对于显示轮廓，把石墨烯部分增加个quicksurf方式显示方式，材质用ghost
对于显示石墨烯，用line或licorice（减小bond radius）
小分子用CPK或者licorice显示

sobereva 发表于 Post on 2022-11-9 20:09:09

王子璇发表于 2022-11-9 16:31
1.请问如何用VMD绘图才能显示成这两个图的样子呢？
2.各位有更好的绘制效果吗？既能看到炭结构又能观察有 ...

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

王子璇 发表于 Post on 2022-11-9 16:31:08

1.请问如何用VMD绘图才能显示成这两个图的样子呢？
2.各位有更好的绘制效果吗？既能看到炭结构又能观察有机小分子的吸附状态。
（抱歉没有检查帖子，字打错了）

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