计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

原子选择问题,无法进行原子选择。

查看数: 3166 | 评论数: 7 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2022-11-9 16:45

正文摘要:

    大家好,我想请教一下,在VMD中导入pdb文件,想要对不同原子类型呈现不同的形态,但是在进行原子选择时,始终出现如下的问题,想请教一下这是那个地方除了问题呢?谢谢!

回复 Reply

chen0201 发表于 Post on 2022-11-18 15:34:21
熊小熊 发表于 2022-11-16 17:06
这个选择要根据你自己的体系组成选择,你多尝试几次,我也表述不出来,想选择某一类原子,确实不好弄。

你选择的原子数多吗,就是我选择的第一类和第二类原子都有很多个,是不是这个原因呢?
熊小熊 发表于 Post on 2022-11-16 17:06:28
chen0201 发表于 2022-11-16 12:01
请问你解决了吗,我也是这个问题,并且换成了name 和element也不行

这个选择要根据你自己的体系组成选择,你多尝试几次,我也表述不出来,想选择某一类原子,确实不好弄。
chen0201 发表于 Post on 2022-11-16 12:01:28
请问你解决了吗,我也是这个问题,并且换成了name 和element也不行
熊小熊 发表于 Post on 2022-11-11 20:42:18
sobereva 发表于 2022-11-10 14:43
仔细看此文
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504(http://bbs.keinsci.com/thread-14 ...

好的,谢谢老师。
熊小熊 发表于 Post on 2022-11-11 20:41:53
snljty2 发表于 2022-11-9 19:47
看手册,选区不是这么写的。如果元素名,比如element P。就是你那两个框的内容都得点。

好的,谢谢!
sobereva 发表于 Post on 2022-11-10 14:43:30
仔细看此文
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html

还得注意仅当你的pdb里记录了元素信息时才能用element P,看
在VMD程序里对不同元素的原子用不同颜色显示的方法
http://sobereva.com/624http://bbs.keinsci.com/thread-26306-1-1.html
snljty2 发表于 Post on 2022-11-9 19:47:20
看手册,选区不是这么写的。如果元素名,比如element P。就是你那两个框的内容都得点。

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-15 18:40 , Processed in 0.189214 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list