镇魂歌 发表于 2016-5-27 09:40
yz方向加足够的真空是防止相互影响么，那10埃真空，可以么

看啥程序算，一般来说10~15A，严格点可以测试一下（记得偶极修正），如DMol3这种，真空区域对计算量影响几乎可以忽略不计，尽情取。

卡开发发 发表于 2016-5-26 20:57
如沿着x方向的1D系统，如果放置在3D的PBC盒子中计算，yz两个方向不仅需要足够大的真空，还应当进行偶极矩 ...

yz方向加足够的真空是防止相互影响么，那10埃真空，可以么

镇魂歌 发表于 2016-5-26 19:19
好的，谢谢老师

如沿着x方向的1D系统，如果放置在3D的PBC盒子中计算，yz两个方向不仅需要足够大的真空，还应当进行偶极矩修正。

好的，谢谢老师

镇魂歌 发表于 2016-5-26 17:43
老师，文献中也是对聚苯胺的一个单元建的盒子。那文献中PANI的能带是怎么算的，恳请老师指教，谢谢。

图中这些都是周期性的。你可以先建个较长的聚合物分子，然后将盒子正好框住重复单元，删掉其余原子，然后做PBC计算就行了。

你这不叫聚合物，只是寡聚物而已。
周期性体系才有能带的概念，像你算的这个寡聚物单体，只能算轨道能级，没法说能带。算寡聚物轨道能级也不用设盒子做PBC，就拿量化程序当孤立体系算个单点就完了。
只有当你算无限延展的聚合物，才需要把其中重复单元放盒子里做周期性计算。