对存在原子间互斥的体系做弱相互作用分析时遇到的问题

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发布时间: 2022-11-16 17:21

各位老师好！我用2个甲烷分子的体系，调整它们之间一对儿氢原子之间的距离至1.3埃，想通过波函数分析方法查看它们在近距离接触下的相互作用。波函数的计算用的关键词是B3LYP/6-311G* em=gd3BJ ，并且在这个级 ...

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masgils 发表于 Post on 2022-11-21 15:51:58

老师我还想再问下，我想做定量分析，查看每一对原子之间的相互作用，不知道怎么区分它们之间是互相吸引还是排斥。在Multiwfn文件输出的atmdg.txt中，每一对原子贡献的dg值怎么才能区分是互相吸引还是互相排斥呢？我看了等值面图的颜色，不知道怎么对应到txt文件中的每一对原子上。

masgils 发表于 Post on 2022-11-17 09:34:46

明白了，谢谢社长

sobereva 发表于 Post on 2022-11-16 20:26:35

做IGMH分析用的结构应当做过几何优化。人为强行把两个分子拉得很近，哪怕二者是互斥的，由于作用区域电子密度较大，也必然会显示成蓝色的
仅当结构优化过，显示成蓝色的才能体现有内在的显著吸引作用

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