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关于分子动力学添加限制,及酶与底物模拟的相关问题请教

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发布时间: 2022-11-17 15:27

正文摘要:

本帖最后由 uenh1998 于 2022-11-17 16:25 编辑 打扰一下社长,想问一下社长几个问题: 1、最近在做溶液钙离子移动到某蛋白上的分子动力学模拟,蛋白上共可结合5个钙离子,在模拟100ns时,已经结合上2个钙离子, ...

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Chenxi 发表于 Post on 2025-6-18 21:20:11
uenh1998 发表于 2022-11-17 20:28
 抱歉社长是这一句话,我理解错了,那请社长指点一下,对这种结合相当不稳定的体系,如果分析能量的话 ...

您好,请问这个问题您解决了吗,我目前也是遇到了跑动力学无法稳定的体系,不知道该如何进行分析
sobereva 发表于 Post on 2022-11-17 18:58:38
1 转就转,没关系。为了视觉上看起来方便,用VMD做个align消除整体运动就完了

2 我不知道“底物的结合必定不稳定”怎么来的

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