tomwong4253 发表于 2022-11-23 19:50
暂时木有想到。。。估计得trajin一帧一帧扒下来然后再重新trajout一帧一帧输出回去？那样太麻烦了

好嘞，谢谢老师，我自己再看看

哇卡卡卡卡卡 发表于 2022-11-23 15:12
谢谢老师的指导！我自己再去查查资料。老师，您印象中有将nc轨迹反过来的操作吗，或者其他类似操作。

暂时木有想到。。。估计得trajin一帧一帧扒下来然后再重新trajout一帧一帧输出回去？那样太麻烦了

tomwong4253 发表于 2022-11-22 21:37
出现这种顺序是必然的，trajin可没这么聪明，只会按照先后顺序机械性地将轨迹前后连在一起，你第一条轨迹是 ...

谢谢老师的指导！我自己再去查查资料。老师，您印象中有将nc轨迹反过来的操作吗，或者其他类似操作。

出现这种顺序是必然的，trajin可没这么聪明，只会按照先后顺序机械性地将轨迹前后连在一起，你第一条轨迹是TS-reactant，第二条轨迹是TS-product，拼起来当然就是TS→reactant→TS→product。要达到你说的那个效果，你得搞到一条reactant→TS的轨迹才行。

tomwong4253 发表于 2022-11-21 23:20
vmd打开crd的时候选择“Amber Trajetories with Periodic Box”试试，另外用不着autoimage，vmd正常打开之 ...

谢谢老师的指导！老师，这里方便再问您一个问题吗，就是我将两条nc轨迹合并之后，发现并不是头尾相连，拼接后的轨迹是TS→reactant→TS→product，实际上应该是reactant→TS→product，在拼接的时候是有什么要注意的吗

vmd打开crd的时候选择“Amber Trajetories with Periodic Box”试试，另外用不着autoimage，vmd正常打开之后用自带的工具去align就行了。