my_aman 发表于 2022-11-26 20:15
谢谢社长，基于您和文献，打算参考这个图回复审稿人。其中上图的关键词是freq，下图的关键词是freq=anhar ...

审稿人也没提振动的问题，给这么张图也未必有什么意义。而且你的体系做非谐振计算都可能算不动

my_aman 发表于 2022-11-26 14:08
这个是文献上的图，请问关键词分别设置成freq和freq=anharm，就能实现上图？

这得看文献的计算细节部分。freq=anharm不是计算非谐振谱的唯一方式

wzkchem5 发表于 2022-11-26 21:02
这个结构优化收敛了吗？
正常情况下谐振谱和非谐振谱不会差这么多吧

这个是文献上的图，请问关键词分别设置成freq和freq=anharm，就能实现上图？

my_aman 发表于 2022-11-26 13:15
谢谢社长，基于您和文献，打算参考这个图回复审稿人。其中上图的关键词是freq，下图的关键词是freq=anhar ...

这个结构优化收敛了吗？
正常情况下谐振谱和非谐振谱不会差这么多吧

wzkchem5 发表于 2022-11-21 02:37
可能审稿人看你的文章没看仔细。
可以说一下，分子动力学本来就是包含anharmonic effect的，所以审稿人 ...

谢谢您，打算算个红外谱，比较harmonic 和anharmonic 的区别

my_aman 发表于 2022-11-20 11:19
谢谢社长，光谱和热力学量都没涉及。就是简单的在不同温度下，跑了个结构-能量的轨迹。审稿人却坚持要算 ...

可能审稿人看你的文章没看仔细。
可以说一下，分子动力学本来就是包含anharmonic effect的，所以审稿人第一句话（说作者用了harmonic approximation）并不正确。当然这不妨碍审稿人要求你研究anharmonic effect的影响，所以你可以用谐振子模型再算一遍吸附自由能之类的，和动力学结果对比，两者的差别可以在一定程度上反映anharmonic effect的贡献。

my_aman 发表于 2022-11-20 18:19
谢谢社长，光谱和热力学量都没涉及。就是简单的在不同温度下，跑了个结构-能量的轨迹。审稿人却坚持要算 ...

如果研究只是涉及动力学模拟，那么没有非谐振效应的事。
不知道审稿人理解到哪里去了。他若非要让你做所谓的非谐振分析，至少他理应给出点文献作为例子表明他想让你分析的是什么

sobereva 发表于 2022-11-20 14:22
看你具体算什么问题
如果是振动光谱，基于AIMD轨迹得到的振动光谱直接就体现了非谐振效应。Gaussian做freq ...

谢谢社长，光谱和热力学量都没涉及。就是简单的在不同温度下，跑了个结构-能量的轨迹。审稿人却坚持要算这个，我是不是可以反驳一下呢？

看你具体算什么问题
如果是振动光谱，基于AIMD轨迹得到的振动光谱直接就体现了非谐振效应。Gaussian做freq=anharm计算结合Multiwfn也可以绘制考虑非谐振的红外光谱，此文说了
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD、VCD和ROA光谱图
http://sobereva.com/224

如果是算热力学量，可以用Gaussian做freq=anharm的非谐振计算（ORCA等程序也支持），得到考虑非谐振效应的热力学量。