本帖最后由 rugals 于 2022-11-20 20:52 编辑 真步 发表于 2022-11-20 20:17 你这么写关键词 高斯不认识 D3是写成em=gd3 def2-svp的横杠去掉 |
(1)我不是大佬,我只是个学生 。(2)在http://sobereva.com/210的后半段,社长非常详细地写了怎么在高斯中规范地使用DFT-D。 (3)在https://gaussian.com/basissets/上面有高斯能识别的各个基组关键词的写法。 |
wjc404 发表于 2022-11-20 12:39 非常感谢,但是还有一个问题,我在G16上使用B3LYPD3/def2-SVP关键词进行尝试,结果在LINK1就出现报错,用b3lyp/6-31g却能正常计算。 我特别想重复一下大佬的柔性扫描,想请教一下是哪个环节出现了问题,像这样的计算会使用多少计算资源。 %chk=pi2.chk %mem=4GB %nprocs=4 Will use up to 4 processors via shared memory. ----------------------- #p B3LYPD3/def2-SVP opt ----------------------- QPErr --- A syntax error was detected in the input line. #p B3LYPD3/def2-SVP opt Last state= "GCL" TCursr= 3918 LCursr= 3 Error termination via Lnk1e in /home/software/g16A03/g16/l1.exe at Sun Nov 20 19:55:50 2022. Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 0.1 seconds. Elapsed time: 0 days 0 hours 0 minutes 0.0 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 6 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 |
sobereva 发表于 2022-11-20 13:52 谢谢sob老师! |
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甭用这种垃圾基组,仔细看下文之前不要做任何计算,白浪费时间 谈谈量子化学中基组的选择 http://sobereva.com/336(http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html) 甭写scf=(maxcyc=500,conver=8) gfinput 这种垃圾关键词,好好看 常见的多余的和被滥用的Gaussian关键词 http://sobereva.com/331(http://bbs.keinsci.com/thread-3460-1-1.html) Syn型分子内色散作用不可忽视,用B3LYP必须带上D3,仔细看下文 谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的 http://sobereva.com/557(http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html) 谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?” http://sobereva.com/413(http://bbs.keinsci.com/thread-9772-1-1.html) 建议把下文也看了,免得老犯低级错误 谈谈学量子化学如何正确地入门 http://sobereva.com/355(http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html) |
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本帖最后由 wjc404 于 2022-11-20 12:55 编辑 https://www.sciencedirect.com/sc ... i/S0022286001005932对二苯乙二酮的OCCO二面角进行了扫描,只有一个最小点,是介于顺式和反式之间的扭曲式。 用B3LYP-D3/def2-SVP对二苯乙二酮的OCCO二面角做柔性扫描,得到下图,只有一个最低点。
这也比较好理解,二苯乙二酮的两个PhCO基团之间的共轭本来就不强(平面化倾向不强),顺式时两个苯环空间排斥太强,反式时一个PhCO的2号位氢和另一个PhCO的氧有空间排斥。 |
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一个E式一个Z式 建模的时候通过二面角调整初始结构,一般情况下如果有极小值点的话,opt过程会落到这个点的。 |
| 建模的时候最大限度让模型接近于想得到的结构,如果想找能量最小点的结构可以对于柔性分子可以进行构象搜索 |
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