sobereva 发表于 2022-11-24 00:55
1 能。会

2 明显同一个碳上还有个氢，氢跟羟基的位置又不可能交换

非常非常感谢卢老师的解答！

mgqqlwq 发表于 2022-11-22 11:18
谢谢卢老师您的回复！
抱歉，再麻烦追问您两个问题
1. 这种单体结构的差异，如果用量子化学的方法的话 ...

1 能。会

2 明显同一个碳上还有个氢，氢跟羟基的位置又不可能交换

sobereva 发表于 2022-11-22 00:48
1 正常

2 对于当前体系不可能

谢谢卢老师您的回复！
抱歉，再麻烦追问您两个问题
1. 这种单体结构的差异，如果用量子化学的方法的话，可以分辨出他们的差别吗？比如电荷的分布会不同？
2. 请问下您觉得键的方向不可能会发现变化的原因是什么呢？是因为这种dihedral转变的势垒比较高吗？

mgqqlwq 发表于 2022-11-21 12:07
谢谢卢老师回复！
还想请教您几个问题，能不能请您再帮助解答下。
1. 两个不同单体的力场参数是一样的 ...

1 正常

2 对于当前体系不可能

3 两个羟基位置的不同会造成形成氢键的协同性有一定不同，和水的相互作用可能有不可忽视的差异

sobereva 发表于 2022-11-20 13:45
结构明显有差别，会体现在模拟结果上

谢谢卢老师回复！
还想请教您几个问题，能不能请您再帮助解答下。
1. 两个不同单体的力场参数是一样的，这个是正常的对吧？就是不管哪个力场或者生成力场文件的方法都无法区分出这种键方向上的差别，因为原子间的其他成键状态都是一样的，所以力场参数会是一样的。不知道我这个理解是否正确？
2. 这种键朝向上的变化，在分子动力学模拟中尤其是如果有比较高温度下的弛豫的话，键的朝向是有可能发生变化的对吗？一种单体是有可能会变成另外一种单体的是吗？
3. 您觉得哪些性质能在分子动力学模拟的结果上体现出来呢？我要做一些力学和与水相互作用的模拟，我担心两种单体组成的聚合物不会有显著性质上的差别，这样最后可能模拟做的意义就不大了。
谢谢您了！

结构明显有差别，会体现在模拟结果上