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求助Gromacs模拟swissmodel同源模建得到的蛋白与小分子对接后的结构出错

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danyunlee

发布时间: 2022-11-25 14:16

正文摘要:

我在swissmodel将同源模建得到的蛋白与设计的小分子进行分子对接后，做到动力学这一步时，输入命令gmx mdrun -deffnm md_0_10显示如下：求教各位大神，具体该怎么解决这个问题，Gromacs小白一枚。

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sobereva 发表于 Post on 2022-11-25 20:11:33

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “ Gromacs求助” 改了，以后务必注意

danyunlee 发表于 Post on 2022-11-25 16:46:48

谢谢牧生大侠，已解决（删除-update gpu）。

牧生 发表于 Post on 2022-11-25 14:42:34

你是不是用了-update gpu命令。该命令不支持虚拟点的

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