计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

求助orca利用TDDFT计算光谱时出现35072错误

查看数: 18260 | 评论数: 19 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2016-5-29 11:19

正文摘要:

本帖最后由 yaochuang 于 2016-5-30 10:15 编辑 各位老师,请教大家一个问题:     最近在利用ORCA计算一个分子(126个原子)的吸收光谱时,总是出现以下错误:(对结果的分析,发现可能是由于硬盘 ...

回复 Reply

huangyoyo 发表于 Post on 2019-3-25 08:17:06
本帖最后由 huangyoyo 于 2019-3-25 09:19 编辑
sobereva 发表于 2019-3-22 19:22
ORCA都不支持TDDFT二阶解析导数,按手册里的方式去算你的体系,猴年马月去

那么例子中优化所有的激发态的目的是什么?
sobereva 发表于 Post on 2019-3-22 19:22:37
huangyoyo 发表于 2019-3-22 16:25
如果要模拟振动分辨的精细光谱,不是要输入每个激发态的Hess文件么?

ORCA都不支持TDDFT二阶解析导数,按手册里的方式去算你的体系,猴年马月去
huangyoyo 发表于 Post on 2019-3-22 16:25:06
Novice 发表于 2019-3-21 11:03
这个任务我也做了,你这么写估计能算一个月,这是ORCA模拟的振动分辨的精细光谱,Sob老师说的很明白了。

如果要模拟振动分辨的精细光谱,不是要输入每个激发态的Hess文件么?
Novice 发表于 Post on 2019-3-21 11:03:16
huangyoyo 发表于 2019-3-21 09:37
再比如这个输入文件,仅仅考虑S0和S1的振动耦合?为什么要优化所有的激发态?

这个任务我也做了,你这么写估计能算一个月,这是ORCA模拟的振动分辨的精细光谱,Sob老师说的很明白了。
让你变成回忆 发表于 Post on 2019-3-21 10:01:27
huangyoyo 发表于 2019-3-21 09:37
再比如这个输入文件,为什么考虑振动耦合仅仅需要S0和S1的hess文件?为什么考虑振动耦合的话需要优化激发 ...

我最近正好也在看ORCA的ESD模块,下面是我的看法:
在社长写的“振动分辨的电子光谱的计算”(http://sobereva.com/223)提到了FC近似、HT近似,考虑了HT效应,就是考虑Vibronic coupling,是需要电子的波函数对核坐标的导数信息,所以这里需要提供一个Hessian。
因为我也是刚开始接触ORCA的ESD模块,以上是个人看法,如有错误,还请sob老师指出。
huangyoyo 发表于 Post on 2019-3-21 09:37:14
本帖最后由 huangyoyo 于 2019-3-21 10:01 编辑
sobereva 发表于 2019-3-20 16:51
前面说了,不考虑振动耦合就根本不需要hess

再比如这个输入文件,仅仅考虑S0和S1的振动耦合?为什么要优化所有的激发态?

QQ截图20190321092511.png (84.88 KB, 下载次数 Times of downloads: 49)

QQ截图20190321092511.png
sobereva 发表于 Post on 2019-3-20 16:51:18
huangyoyo 发表于 2019-3-20 15:12
这是那一节的所有信息,hess 文件用于计算吸收速率?如果问我仅仅需要吸收谱,只需要用tddft就可以了。

前面说了,不考虑振动耦合就根本不需要hess
huangyoyo 发表于 Post on 2019-3-20 15:12:54
本帖最后由 huangyoyo 于 2019-3-20 15:14 编辑
sobereva 发表于 2019-3-20 14:46
你没有正确理解这个例子的意图

这是那一节的所有信息,hess 文件用于计算吸收速率?如果问我仅仅需要吸收谱,只需要用tddft就可以了。

QQ截图20190320151051.png (179.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 55)

QQ截图20190320151051.png

QQ截图20190320151156.png (221.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 53)

QQ截图20190320151156.png
sobereva 发表于 Post on 2019-3-20 14:46:07
huangyoyo 发表于 2019-3-20 14:31
我是看他手册里那个ESD模块的输入文件中要求的。

你没有正确理解这个例子的意图
huangyoyo 发表于 Post on 2019-3-20 14:31:11
sobereva 发表于 2019-3-20 11:28
“ORCA中计算吸收谱需要激发态的hess文件”这是错误认识。只有计算振动分辨的电子光谱才需要激发态的hess ...

我是看他手册里那个ESD模块的输入文件中要求的。

QQ截图20190320143037.png (78.16 KB, 下载次数 Times of downloads: 45)

QQ截图20190320143037.png
sobereva 发表于 Post on 2019-3-20 11:28:35
huangyoyo 发表于 2019-3-20 09:09
恩,谢谢!
另外我想用NPT系综做分子动力学再将结果在ORCA中计算吸收谱。
首先我的结果算频率分析得到 ...

“ORCA中计算吸收谱需要激发态的hess文件”这是错误认识。只有计算振动分辨的电子光谱才需要激发态的hess
只对某个结构计算吸收谱而且不考虑振动耦合的话,直接做TDDFT,然后用Multiwfn绘图就完了,见

使用ORCA在TDDFT下计算旋轨耦合矩阵元和绘制旋轨耦合校正的UV-Vis光谱
http://sobereva.com/462http://bbs.keinsci.com/thread-12114-1-1.html
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD、VCD和ROA光谱图
http://sobereva.com/224

可以对动力学过程的所有帧(或有间隔地提取)计算光谱,然后求平均。这在Multiwfn里相当于绘制构象权重平均光谱,只不过权重都相同。


huangyoyo 发表于 Post on 2019-3-20 09:09:02
sobereva 发表于 2019-3-19 18:29
一般情况都不建议用RIJK,限制多,体系稍微大点效率就显著低于RIJCOSX

恩,谢谢!
另外我想用NPT系综做分子动力学再将结果在ORCA中计算吸收谱。
首先我的结果算频率分析得到的基态hess文件是有虚频的(因为T和p都较高),其次,ORCA中计算吸收谱需要激发态的hess文件,而您之前提过我的结果是不能进行激发态几何优化的(因为激发态几何优化是在真空下进行的,温度和压力的影响不能反映出来),综合这两个因素,我想问NPT之后的结果能在ORCA中计算吸收谱么?若不能,可否推荐一个可行的方法?
sobereva 发表于 Post on 2019-3-19 18:29:22
一般情况都不建议用RIJK,限制多,体系稍微大点效率就显著低于RIJCOSX
huangyoyo 发表于 Post on 2019-3-19 17:18:35
sobereva 发表于 2019-3-19 17:15
凡是碰到类似于卡住的问题,先把基组改小、计算级别降低,弄清楚是算不动还是其它问题

换成RICOSX就能算了

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-19 08:43 , Processed in 0.178328 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list