uenh1998 发表于 2022-11-26 01:10
抱歉老师，以后字体会减小的。   第二个问题是这样的，3个跨膜蛋白，一个是pdb原始结构，另外两个分 ...

如果图省事的话，可以先一次性插入试试，不行的话再分三次

你直接用CHARMM-GUI建模得了

sobereva 发表于 2022-11-25 23:03
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    抱歉老师，以后字体会减小的。   第二个问题是这样的，3个跨膜蛋白，一个是pdb原始结构，另外两个分别是原始结构正向负向旋转180度的镜像结构，按社长说的话，3个就要当做3个膜蛋白分别插入了吧。如果这样的话，是需要写3个dat文件，跑3次插入蛋白的动力学吗？

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2 我不知道你说的三个蛋白单体是分散的，还是作为一个完整蛋白的不同单元。如果是前者，需要分别插入，如果是后者，作为整体插入。