求助关于偶极子角度分布的结果分析

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发布时间: 2022-11-27 22:34

如图，求助社长，在模仿论文里计算材料表面的亲疏水性，看到文献(Chin. Phys. B Vol. 30, No. 1 (2021) 010503)里有关于偶极子角度分布的图，想试着做一下。我用gmx dipoles做了分析，但是不知道用哪个结果画图，来 ...

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小雷森 发表于 Post on 2022-11-28 10:59:41

sobereva 发表于 2022-11-28 10:47
循环每个水分子，计算O与H...H中点连线方向的矢量，求与界面的夹角。对各帧、各个水都这么算，求各种角度 ...

好的，社长。我去试试

sobereva 发表于 Post on 2022-11-28 10:47:54

小雷森发表于 2022-11-28 10:46
会长，那分析的思路是什么啊？

循环每个水分子，计算O与H...H中点连线方向的矢量，求与界面的夹角。对各帧、各个水都这么算，求各种角度的出现概率

小雷森 发表于 Post on 2022-11-28 10:46:34

sobereva 发表于 2022-11-28 02:18
gmx dipoles应该干不了这个
自己写个VMD脚本分析就完了

会长，那分析的思路是什么啊？

sobereva 发表于 Post on 2022-11-28 02:18:38

gmx dipoles应该干不了这个
自己写个VMD脚本分析就完了

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