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求助ORCA几何优化有机分子一直不收敛

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发布时间: 2022-11-29 12:41

正文摘要:

各位老师,我最近刚开始用ORCA,不是很熟悉,算的时候几何优化一直不收敛,请帮忙看一看是输入文件设置上的原因吗?或者我该怎么设置? chemdraw画的之后用chem3D   MM2优化了之后的结构

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sobereva 发表于 Post on 2022-12-2 02:43:55
fwan1006 发表于 2022-12-1 17:47
sob老师,我按论坛里的装了openmpi和orca5.0.3,然后算的时候老是出现这个问题,您能帮忙解读一下吗?

...

没细节没法说,起码上传输入输出文件

如果怀疑是并行的问题,先尝试串行能否运行
sobereva 发表于 Post on 2022-11-30 09:40:01
绝对不要自己手写【新手求助】这种标签,http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给你去了,以后注意

拿HF优化毫无意义,文章根本发不出去。提问时候不要光贴个二维结构,谁也不知道你用的初猜结构到底长什么样,二维结构又体现不出来实际立体结构。
倘若这分子能稳定存在,能量较低构象肯定会出现分子内氢键。摆初猜结构时把这点考虑进去
exity 发表于 Post on 2022-11-29 18:40:24
这方法基组搭配也挺有意思的。
zjxitcc 发表于 Post on 2022-11-29 16:55:32
fwan1006 发表于 2022-11-29 13:55
- -, 我这个orca的版本太旧了,还是3.0.1的,竟然识别不了B97-3C

强烈不建议继续算下去,当务之急是立即下载ORCA 5.0.3

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wzkchem5 发表于 Post on 2022-11-29 16:21:01
fwan1006 发表于 2022-11-29 08:49
是,这个分子是虚构的。它结构不稳定是不是也是导致几何优化不出来的原因之一?

不稳定的分子一般优化会倾向于困难一些,但是两者的关系也不是特别大。
我又看了一下你的理论级别,这个级别即使收敛了结果也是不能用的,必须改用DFT方法(包括但不限于B3LYP、M062X),如果使用B3LYP等不能描述色散的泛函的话,还要加色散校正。
fwan1006 发表于 Post on 2022-11-29 15:49:51
wzkchem5 发表于 2022-11-29 15:11
此外这个分子不稳定,有脱SO2、然后生成HSO3-,用硫原子向醌羰基亲核加成的倾向。如果实验表征数据不完备的 ...

是,这个分子是虚构的。它结构不稳定是不是也是导致几何优化不出来的原因之一?
wzkchem5 发表于 Post on 2022-11-29 15:11:22
此外这个分子不稳定,有脱SO2、然后生成HSO3-,用硫原子向醌羰基亲核加成的倾向。如果实验表征数据不完备的话,建议重新考虑一下结构是不是你画的样子
fwan1006 发表于 Post on 2022-11-29 13:55:32
牧生 发表于 2022-11-29 13:17
把这个羟基往箭头方向挪过去一点会比较好

你这个优化的级别需要商酌一下,好歹用b97-3c

- -, 我这个orca的版本太旧了,还是3.0.1的,竟然识别不了B97-3C
牧生 发表于 Post on 2022-11-29 13:17:48
本帖最后由 牧生 于 2022-11-29 13:27 编辑

把这个羟基往箭头方向挪过去一点会比较好

你这个优化的级别需要商酌一下,好歹用b97-3c


http://bbs.keinsci.com/thread-13560-1-1.html

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