sobereva 发表于 2022-12-1 06:39
下文的例子介绍了怎么计算整个空间的自由体积
使用Multiwfn计算晶体结构中自由区域的体积、图形化展现自由 ...

好勒，谢谢老师!

下文的例子介绍了怎么计算整个空间的自由体积
使用Multiwfn计算晶体结构中自由区域的体积、图形化展现自由区域
http://sobereva.com/617（http://bbs.keinsci.com/thread-25241-1-1.html）

参考下文，写个脚本，依靠上文介绍的功能依次每次计算一个薄层的自由体积就能实现目的。计算每个薄层时恰当定义计算区域的原点和边长即可
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612（http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html）

如果计算的帧数不多还好。如果计算的帧数很多，可能会很耗时，应考虑是否能通过别的做法实现类似最终目的，比如用gmx density计算密度分布曲线。