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机械力化学中的 CoGEF方法如何实现

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发布时间: 2022-12-4 23:34

正文摘要:

本帖最后由 chuan437 于 2022-12-4 23:35 编辑 现在研究聚合物机械力化学化学有一种方法叫做CoGEF方法。如下图所示,固定这个大分子两端的碳原子。然后不断增加这两个碳原子之间的距离,直到把这个分子最中间的 ...

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ClaudiaZ 发表于 Post on 3 day ago
同问,如何在高斯中实现用CoGEF,在原有基础上对两个原子额外施加1.2埃伸长长度的机械力
sobereva 发表于 Post on 2022-12-5 02:09:10
“能面扫描只是改变两个成键原子之间的键长距离”完全没这回事。明明任意两个原子间的距离都可以扫描,比如北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KEQC_content.html)里的例子



Spartan在这方面没有任何优势,而且又收费又冷门
这种问题不适合分子力场。本来精度就远不如常用的DFT,而且大部分常见力场对化学键都没有正确的解离行为。

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chuan437 + 4 我很赞同

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Kalinite 发表于 Post on 2022-12-5 00:15:18
本帖最后由 Kalinite 于 2022-12-5 00:18 编辑

大多数文献里CoGEF一般是用spartan,可以在分子力学层面做。
要用Gaussian做的话,可以做柔性扫描,把锚定的两个原子(而不是基团)距离作为扫描变量,步长设置的小一些,计算量应该是比较大的。另外就是Gaussian只能固定步长做。
严格考察施加外力的情况,还得是ORCA。

不过我没具体用过spartan,最近合作者问了我这方面的东西,我个人以为分子力学做是不太合适的,毕竟参数都是针对比较靠近平衡位置进行拟合,对于拉开一定距离,偏离平衡位置的势能面描述的会有问题,对于可能涉及交叉的问题就更大了。

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chuan437 + 4 谢谢分享

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