计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

求助:gromacs执行npt预平衡时生成的npt.edr文件消失,无法查看压力和密度变化

查看数: 1377 | 评论数: 2 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
Wcp
发布时间: 2022-12-7 10:57

正文摘要:

本帖最后由 Wcp 于 2022-12-7 10:57 编辑 1. 配置(系统环境:ubuntu20.04.5 LTS 64位,处理器:8代i5,显卡:gtx1050,显卡驱动:nvidia driver 510,cuda版本:10.2,gromacs版本:2019.6,cmake版本:3.16.3, ...

回复 Reply

Wcp 发表于 Post on 2022-12-7 11:50:23
sobereva 发表于 2022-12-7 11:43
不是GROMACS的问题,是操作系统层面的问题,检查有没有什么特殊设置、计划任务之类会自动删文件。死活搞不 ...

老师好。
在执行nvt平衡时,步数设置在50000时可正常生成.edr和.log文件,且不消失
而且在npt(1ns)和最终md(50ns)模拟过程中,生成的.edr和.log文件不存在消失问题,而且在运行中也可随时调用取log文件
sobereva 发表于 Post on 2022-12-7 11:43:11
不是GROMACS的问题,是操作系统层面的问题,检查有没有什么特殊设置、计划任务之类会自动删文件。死活搞不明白干脆重装一次系统

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-16 22:18 , Processed in 0.229318 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list