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求助:蛋白嵌入细胞膜group被删,应该改用什么指令

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发布时间: 2022-12-22 20:48

正文摘要:

各位前辈:       在学习将1a11跨膜蛋白嵌入预平衡的DPPC磷脂双层膜教程过程中,发现cutoff-scheme = group的这一条没法用了,只能用Verlet,想请教一下应该如何再行嵌入蛋白质。

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sobereva 发表于 Post on 2022-12-23 13:29:23
用GROMACS老版本
北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)里目前都是用的2018.8,课上我讲1a11这个例子用的就是2018.8。插进膜之后,实际MD模拟愿意用什么版本用什么。

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