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给Znpc 分子加赝势优化,分子散架

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发布时间: 2022-12-22 20:49

正文摘要:

在优化 Znpc 的过程中,在B3LYP方法上,对C,H,N原子选用6-31G*,给 Zn 加赝势LANL2DZ,结果总是出现距离Zn最近的四个 N原子 向中心的 Zn 靠拢,造成分子散架从而难以达到收敛限。 之后,用相同的输入文件,去掉赝 ...

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好多于 发表于 Post on 2022-12-27 09:08:37
sobereva 发表于 2022-12-25 23:58
对于纯平面体系,大多数情况标准朝向本来就是XY平面,所以加nosymm依然是多余的。即便最后发现实际被置于 ...

收到,谢谢老师的回帖
sobereva 发表于 Post on 2022-12-25 23:58:07
好多于 发表于 2022-12-24 19:14
好的谢谢老师回复。我需要将分子固定在xy平面,后期需要做z(垂直分子平面)方向的拉曼强度,还要做分子 ...

对于纯平面体系,大多数情况标准朝向本来就是XY平面,所以加nosymm依然是多余的。即便最后发现实际被置于了诸如YZ平面上,也可以之后再用下文提到的功能令其精确摆在XY平面上

Multiwfn中非常实用的几何操作和坐标变换功能介绍
http://sobereva.com/610http://bbs.keinsci.com/thread-24674-1-1.html
好多于 发表于 Post on 2022-12-24 19:14:44
sobereva 发表于 2022-12-23 13:31
这和做不做扫描没有任何联系
什么时候才需要用nosymm,看
谈谈Gaussian中的对称性与nosymm关键词的使用 ...

好的谢谢老师回复。我需要将分子固定在xy平面,后期需要做z(垂直分子平面)方向的拉曼强度,还要做分子的拉曼图像。所以为了后期方便起见,还是加了nosymm,
sobereva 发表于 Post on 2022-12-23 13:31:12
好多于 发表于 2022-12-22 21:38
好的谢谢。不过我这个后边要进行扫描,所以还是留着nosymm把

这和做不做扫描没有任何联系
什么时候才需要用nosymm,看
谈谈Gaussian中的对称性与nosymm关键词的使用
http://sobereva.com/297http://bbs.keinsci.com/thread-1355-1-1.html
你这个体系明显有对称性,让Gaussian利用对称性算得又快又容易收敛
好多于 发表于 Post on 2022-12-22 21:41:55
LittlePupil 发表于 2022-12-22 21:32
除了把“gen”改成“genecp”外,也可以保留“gen”但加上“Pseudo=Read”;
设置赝势时不止要指定赝势基 ...

好的谢谢,已经在看帖的路上了
好多于 发表于 Post on 2022-12-22 21:38:15
本帖最后由 好多于 于 2022-12-22 21:42 编辑
chands 发表于 2022-12-22 21:23
将gen改成genecp并加上赝势。
去掉pop=full
建议开对称性。

好的谢谢。不过我这个后边要进行扫描,所以还是留着nosymm把
LittlePupil 发表于 Post on 2022-12-22 21:32:38
除了把“gen”改成“genecp”外,也可以保留“gen”但加上“Pseudo=Read”;
设置赝势时不止要指定赝势基组,还要指定赝势,参看:
《详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入》
http://sobereva.com/60
如果有特殊需求可以保留“pop=full”,但依然不建议优化时用这个,会使输出文件巨大。
最后,给的内存未免太小了,虽然Gaussian的普通DFT计算对内存需求不大。
chands 发表于 Post on 2022-12-22 21:23:34

将gen改成genecp并加上赝势。
去掉pop=full
建议开对称性。
好多于 发表于 Post on 2022-12-22 21:00:01
zjxitcc 发表于 2022-12-22 20:54
一般是由于自定义基组格式写错了不信可以上传输入文件(指上传gjf文件,不是指将其复制粘贴在帖子里)

附上了
zjxitcc 发表于 Post on 2022-12-22 20:54:57
一般是由于自定义基组格式写错了不信可以上传输入文件(指上传gjf文件,不是指将其复制粘贴在帖子里)

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