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计算过渡态出现两个虚频,第二个虚频无法消除

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gjf
发布时间: 2022-12-23 15:06

正文摘要:

各位老师,我在计算过渡态时,结果出现了两个虚频,一个是正常的虚频,震荡方向符合反应成键方向,但是又出现了一个极小的虚频,用了帖子上很多方法无法消除,Gaussian中几何优化收敛后Freq时出现NO或虚频的原因和解 ...

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gjf 发表于 Post on 2022-12-24 14:40:18
zjxitcc 发表于 2022-12-24 14:07
把安装包上传就行了。。。你总是使用某个软件登录服务器的吧,比如SSH Secure Shell Client, MobaXterm,  ...

谢谢老师,茅塞顿开,太感谢了
zjxitcc 发表于 Post on 2022-12-24 14:07:59
gjf 发表于 2022-12-24 13:49
老师,那怎么把新版本的安装包远程弄到服务器上呢,服务器是linux系统,我是新手对这个确实很迷惑

把安装包上传就行了。。。你总是使用某个软件登录服务器的吧,比如SSH Secure Shell Client, MobaXterm, XShell等等,这些软件都有上传文件的功能。
gjf 发表于 Post on 2022-12-24 13:49:27
zjxitcc 发表于 2022-12-24 12:54
这与“服务器不在身边”没有关系,就是用命令行解压 压缩包、写好环境变量,几分钟的事。

老师,那怎么把新版本的安装包远程弄到服务器上呢,服务器是linux系统,我是新手对这个确实很迷惑
zjxitcc 发表于 Post on 2022-12-24 12:54:04
gjf 发表于 2022-12-24 12:21
太感谢了,因为服务器不在身边,安装新版本有困难,我先按您说的试试,谢谢老师

这与“服务器不在身边”没有关系,就是用命令行解压 压缩包、写好环境变量,几分钟的事。
gjf 发表于 Post on 2022-12-24 12:21:28
sai77 发表于 2022-12-24 12:05
安装新版本是最简单最彻底的解决方法。
不想重新安装,那就换零阻尼重算。

太感谢了,因为服务器不在身边,安装新版本有困难,我先按您说的试试,谢谢老师
sai77 发表于 Post on 2022-12-24 12:05:35
gjf 发表于 2022-12-24 11:14
老师,只能安装新版本吗,有没有其他解决方法啊

安装新版本是最简单最彻底的解决方法。
不想重新安装,那就换零阻尼重算。

DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210
“注意G09 D.01版D3(BJ)计算频率时色散校正的贡献是不完全准确的,因为忽略掉了依赖于r^-8的那项。对于力常数较大(较硬)的振动模式这个问题的影响可忽略,但对于力常数较小(较软)的振动模式就会造成一定误差,往往会导致虚频的出现(即便优化后已经准确处在极小点位置了)。但是零阻尼没有这个问题,所以G09 D.01的用户如果要算频率的话,还是在零阻尼下优化为宜。不过D3(BJ)的这个问题在G09 E.01版已经得到了修正。”
gjf 发表于 Post on 2022-12-24 11:14:30
PoorChaos 发表于 2022-12-24 11:03
换E 01 或者G16。开动脑筋,你懂的

老师,只能安装新版本吗,有没有其他解决方法啊
PoorChaos 发表于 Post on 2022-12-24 11:03:50
gjf 发表于 2022-12-24 10:58
老师,就是G09 D.01,那这种情况怎么解决呢,只能重新安装新版本吗

换E 01 或者G16。开动脑筋,你懂的
gjf 发表于 Post on 2022-12-24 10:57:41
wjc404 发表于 2022-12-23 18:30
输出文件的前100行里,找“Cite this work as”的下一行。

谢谢,找到了
sobereva 发表于 Post on 2022-12-23 21:58:13
gjf 发表于 2022-12-23 17:15
老师,软件是别人安装的,我也搞不清楚具体的版本号。那应该怎么办啊

哪个主流程序输出文件里不体现版本号
wjc404 发表于 Post on 2022-12-23 18:30:06
gjf 发表于 2022-12-23 17:15
老师,软件是别人安装的,我也搞不清楚具体的版本号。那应该怎么办啊

输出文件的前100行里,找“Cite this work as”的下一行。
gjf 发表于 Post on 2022-12-23 17:15:15
sobereva 发表于 2022-12-23 16:40
说清楚Gaussian具体修订版。G09 D.01的D3(BJ)算频率有bug,这是众所周知的常识

老师,软件是别人安装的,我也搞不清楚具体的版本号。那应该怎么办啊
sobereva 发表于 Post on 2022-12-23 16:40:20
说清楚Gaussian具体修订版。G09 D.01的D3(BJ)算频率有bug,这是众所周知的常识

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