本帖最后由 火车头 于 2022-12-29 10:09 编辑 beefly 发表于 2022-12-29 05:58 大佬一语中的,用的正是def2-TZVP基组搭配ZORA,ORCA5.0.3算出来的结果和3.0.3差的很多,原来是这个原因!我的两个版本也成功运行了(使用各自版本的openmpi,用pbs脚本定义环境变量,提交到不同节点上,同一节点还没试过),现在没有问题。 |
本帖最后由 火车头 于 2022-12-29 10:04 编辑 sobereva 发表于 2022-12-29 03:02 谢谢社长,已经解决!我记得上次自己在帖子下补充说明已经解决了,但好像没发出来。 |
|
本帖最后由 beefly 于 2022-12-29 06:02 编辑 COSMO和CPCM、CPCMC对芯电子性质的影响差不多,不用刻意区分。需要注意的一点是,在3.0版本中,如果def2基组(如def2-TZVP)与相对论哈密顿ZORA、DKH(还有精度高于ZORA的IORA,但用的比较少)搭配,ORCA用的并不是def2-TZVP基组,而是在程序内部改成了ZORA/DKH-def2-TZVP。一些论文作者没注意这点,说自己用的是def2基组,但是用ORCA高版本重复不出结果,就说是CPCMC溶剂模型不好。其实,ZORA/DKH-def2与def2的芯电子性质差距很大,原始的def2结果比较差。在后来的ORCA版本中,程序不会擅自修改基组,用户必须明确指定def2或ZORA/DKH-def2,这样两个版本得到的芯电子性质就有可比性了。 我机器上的ORCA 3.0和5.0版本共用同一版本的OpenMPI,没遇到运行问题。 |
| 参与人数Participants 2 | eV +3 | 收起 理由Reason |
|---|---|---|
|
| + 2 | 这样的经验帖太宝贵了 |
|
| + 1 | 精品内容 |
火车头 发表于 2022-12-28 09:19 让3.0.3标配的OpenMPI版本处于激活状态 |
sobereva 发表于 2022-12-28 03:26 现在的问题就是,我装了3.0.3没法并行计算,但是我和文献对比感觉是差的挺远的;关于两个openmpi版本,我用pbs提交任务,环境变量在pbs里定义按理说是不是也是可以的? |
|
你可以按ORCA手册里说的用CPCMC(solvent),和3.0.3的COSMO做个对比,如果差异不可忽略那就只能用3.0.3了 3.0.x和5.0.x对OpenMPI版本要求明显不同,没法俩同时使用 |
| 更新:改成单核测试成功了,多核不行 |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2026-2-22 16:05 , Processed in 0.255436 second(s), 26 queries , Gzip On.