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计算ECD时遇到的理论与计算拟合不太好的问题,请教下有无其他方法

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发布时间: 2022-12-29 19:14

正文摘要:

想问下结构优化和计算ECD的高斯输入文件有什么问题吗

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sobereva 发表于 Post on 2022-12-30 01:52:25
先把理论谱和实验谱都摆出来,别人才能知道你所谓的不好是什么程度不好,是否实际上根本算不上“不好”

没事甭用def 1代的SVP

最起码得把溶剂模型加上
当前优化出的结构明显不是能量最低的,该有的内氢键都没有

算柔性分子的ECD应当考虑构象搜索问题,仔细看
构型和构象搜索程序Molclus主页:http://www.keinsci.com/research/molclus.html
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html
gentor:扫描方式做分子构象搜索的便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2388-1-1.html
将Confab或Frog2与Molclus联用对有机体系做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-20063-1-1.html
使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html

很多时候还得考虑权重平均,仔细看
使用Multiwfn绘制构象权重平均的光谱
http://sobereva.com/383http://bbs.keinsci.com/thread-6186-1-1.html

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