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使用OT来优化遇到KS energy is an abnormal Value (Nan/Inf)的问题

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发布时间: 2023-1-10 11:50

正文摘要:

老师们好,        我最近使用cp2k来模拟Zn2SnO4体系,使用PBE+DZVP-MOLOPT-SR-GTH+diag体系来优化,老是震荡。        我于是建立超胞,使得a,b,c晶胞参数大约都相等 ...

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LittlePupil 发表于 Post on 2023-1-14 23:40:50
JackHuang 发表于 2023-1-14 00:34
我遇到的情况:
CP2K 7.1 cp2k.popt在装在不同的机器上同样的项目在自己的电脑6核上可以正常运行, 在集群 ...

CP2K对环境极其敏感,你的问题可能是因为两个节点最高支持的指令集一个和编译CP2K的host一样,另一个不一样。
JackHuang 发表于 Post on 2023-1-14 00:35:24
我遇到的情况:
CP2K 7.1 cp2k.popt在装在不同的机器上同样的项目在自己的电脑6核上可以正常运行, 在集群上报错。我以为是我的版本的问题。

于是我重新编译了CP2K 2022版的。 最后有生成cp2k.popt,但是一个链接指向了cp2k.psmp。

CP2K 2022 cp2k.psmp 在集群上20个核的节点上运行正常, 在40核的节点上运行报错。具体是什么原因尚不清楚。

JackHuang 发表于 Post on 2023-1-14 00:34:53
我遇到的情况:
CP2K 7.1 cp2k.popt在装在不同的机器上同样的项目在自己的电脑6核上可以正常运行, 在集群上报错。我以为是我的版本的问题。

于是我重新编译了CP2K 2022版的。 最后有生成cp2k.popt,但是一个链接指向了cp2k.psmp。

CP2K 2022 cp2k.psmp 在集群上20个核的节点上运行正常, 在40核的节点上运行报错。具体是什么原因尚不清楚。

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202301140032452488..png
sobereva 发表于 Post on 2023-1-10 13:50:24
qqppoqq 发表于 2023-1-10 12:56
知道了 谢谢老师 我马上试试 我看见那篇帖子使用的CenOS系统,我使用UBUNTU20.04来安装应该没啥区别吧?

我不对Ubuntu的情况做评论
我极其不喜欢Ubuntu
qqppoqq 发表于 Post on 2023-1-10 12:56:19
知道了 谢谢老师 我马上试试 我看见那篇帖子使用的CenOS系统,我使用UBUNTU20.04来安装应该没啥区别吧?
sobereva 发表于 Post on 2023-1-10 12:37:14
我这里用2023.1 popt版能正常计算
貌似你用的ssmp版,强烈建议改用popt。另外,并行核数建议等于物理核心数,而不要等于总逻辑核心数

你的体系建议用XY周期性结合MT的PSOLVER。另外slab建得太薄。

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