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求助：非极性环形分子亚甲基的H被甲基取代后，其RESP电荷显著增大。

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enthalpy

发布时间: 2023-1-12 18:44

正文摘要:

本帖最后由 enthalpy 于 2023-1-13 13:18 编辑大家好！我对图左下的分子 (MOL2) 用Gaussian 进行了优化并用MK方法计算ESP电势，用Antechamber来拟合RESP电荷，用于蛋白质的分子动力学模拟。由于该分子是蛋白 ...

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enthalpy 发表于 Post on 2023-1-13 15:52:08

sobereva 发表于 2023-1-13 06:13
"ESP电荷"指代不明。仔细看下文里提到的我写的《拟合静电势电荷的计算方法》了解拟合静电势电荷都有多少种 ...

如果适当增大restraint，并且就用Multiwfn 默认计算MK的ESP格点参数，是可以得到合理的RESP电荷。

enthalpy 发表于 Post on 2023-1-13 13:25:03

本帖最后由 enthalpy 于 2023-1-13 13:33 编辑

sobereva 发表于 2023-1-13 06:13
"ESP电荷"指代不明。仔细看下文里提到的我写的《拟合静电势电荷的计算方法》了解拟合静电势电荷都有多少种 ...

谢谢社长的回复。这里的ESP电荷指MK 方法得到的电荷。我去试试用Multiwfn拟合电荷。

sobereva 发表于 Post on 2023-1-13 06:13:14

"ESP电荷"指代不明。仔细看下文里提到的我写的《拟合静电势电荷的计算方法》了解拟合静电势电荷都有多少种，特征各是什么
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441（http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html）

用Multiwfn算RESP电荷，比antechamber灵活得多，看上文。届时有什么问题把涉及的具体文件上传、说明操作步骤和所得结果。

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