求助:拉伸动力学中pullf.xvg图像折线无峰值问题及坐标单位修改

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发布时间: 2023-1-18 09:46

本帖最后由 Nancylee0416 于 2023-1-18 09:51 编辑各位大佬求助，Gromacs2021.1，模拟包含两条链蛋白-小分子结构，拉伸其中一条短链，整个蛋白轨迹能看到结构的变化过程。我的理解初始拉力特别大，是否是我拉伸 ...

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Nancylee0416 发表于 Post on 2023-1-25 21:42:57

求助各位大佬！
缩小盒子体积，折线还是这样

Nancylee0416 发表于 Post on 2023-1-18 09:50:53

另外想问一下，force-time的图像中力的坐标一般是什么单位呢？看到文章中有kcal/mol/A，kj/mol/A？
以及包括RMSD等等分析是都会以A为纵坐标单位，和gromacs分析的单位nm并不相同。我手动在excel中调整结果再用GRACE生成图像。有单位修改的方法吗？
感谢大家！

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