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Gaussian分子朝向问题

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发布时间: 2023-1-26 21:20

正文摘要:

1. 我用优化好的输出坐标在相同水平上又做了一次结构优化,发现第二次刚开始的标准朝向和上一次的输出坐标不同,x和z分量取了相反数分子绕y轴转了180,想知道这是为什么呢,第一次的输出不是已经是标准朝向了吗? 2 ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-1-26 23:41:59
1 已经提示了input orientation,这是输入朝向下的

2 这是标准朝向下的

3 不一码事。计算原理在http://sobereva.com/426里写明了
wzkchem5 发表于 Post on 2023-1-26 22:03:25
标准朝向不是分子坐标的连续函数,当分子对称性高的时候尤其如此。所以两个差别极小的坐标(例如因为坐标四舍五入导致的差别)的标准朝向很可能差别极大。比如一个水分子,任何一个给定的氢原子在标准朝向时有50%概率指向左边,有50%概率指向右边,所以坐标稍微有一点变化,哪怕只是小数点后第10位变了,都可能导致标准朝向差180度

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