NAL ORN氨基酸在CHARMM36力场里原子怎么命名？

查看数: 2204 | 评论数: 4 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2023-1-30 10:54

你好！我想用pdb2gmx生成包涵NAL和ORN氨基酸的肽的参数，但是程序报错显示NAL属于Other类型，不是蛋白质残基，请问是因为我的氨基酸原子命名不对吗？附上氨基酸的PDB结构和报错内容

回复 Reply

Frozen-Penguin 发表于 Post on 2023-1-30 14:35:25

残基类型在residuetypes.dat里面设置，不是aminoacids.rtp，residuetypes.dat和各力场文件在同一级目录下

sobereva 发表于 Post on 2023-1-30 11:59:05

提示写明了，自己改residuetypes.dat，把自定义残基名字写进去让gromacs认成是蛋白质残基

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register