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使用Multiwfn展现过剩电子(excess electron)并计算它的回转半径

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发布时间: 2023-1-30 22:00

正文摘要:

使用Multiwfn展现过剩电子(excess electron)并计算它的回转半径 Using Multiwfn to exhibit excess electrons and calculate their radius of gyration 文/Sobereva@北京科音   2023-Jan-30 1 过 ...

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Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 Post on 2025-7-25 18:02:25
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-8-5 11:34 编辑

J. Chem. Phys. 162, 110901 (2025)这个用CP2K跑水合电子AIMD模拟的工作中,表征水合电子分布的指标除回转半径外还有个“非球形度”(asphericity),和http://sobereva.com/661提到的球形度只考虑表面积和体积不同,定义为<A>=<Tr^2 – 3M>/<Tr^2>(此文中公式错写为Tr^3了,对照先前文献应该是Tr^2),其中Tr和M都能用回转张量的本征值算出来。接近球对称的形状的<A>小得几近于0,而细长的形状的<A>接近1。

既然multiwfn已经能给出二阶矩本征值,输出Tr^2和M应该是小菜一碟;这样逐帧批处理时外部指令提取出各帧Tr^2 – 3M和Tr^2,再分别取时间平均然后相除,就能得到一条轨迹的过剩电子的非球形度了。

编辑:这帖提到的方法似乎也有点关系
zsu007 发表于 Post on 2023-3-2 20:03:48
社长威武!

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